如何通过 Pandoc 和 Knit 从 Rmarkdown 访问 MathJax 扩展（如 siunitx）？

Question

使用Rmarkdownin Rstudio、 usingpandoc和knitr，我的目标是通过 LaTeX 输出 PDF 和使用 .html 输出 HTML MathJax。我想使用一些MathJax可用的扩展，以便为 PDF 目标提供更丰富的 LaTeX。siunitx具体来说，我现在正在尝试使用该扩展，尽管我也对其他扩展感兴趣（例如physics）。

使用siunitxLaTeX 进行 PDF 输出效果很好，但我很难让它与 HTML 输出一起工作。

这是一个 Rmarkdown 文件示例：

---
title: "siunitx test"
author: "chriss"
date: "June 13, 2017"
output:
  html_document:
    mathjax: https://cdn.rawgit.com/mathjax/MathJax/2.7.1/latest.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML
    number_sections: yes
  pdf_document:
    keep_tex: yes
    latex_engine: xelatex
    number_sections: yes
header-includes: \usepackage{siunitx}
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

# The Problem

I would like to be able to use `siunitx` latex macros from `Rmarkdown`,
targetting PDF output via latex and html with MathJax. It should get me proper
formatting of things like $\SI{120}{\W\per\square\m}$ and $\SI{0.8}{\A\per\W}$,
as long as I put them in a latex math environment, so that MathJax picks them
up.

The PDF output is OK when I add the `header-includes: \usepackage{siunitx}` to
the `YAML` header, but how can I access the MathJax `siunitx` extension via the
knitr -> pandoc -> mathjax/html route?

Check: is MathJax working in general: $\frac{1}{r^2}$

这与 PDF 结合得很好，但$\SI{}{}$在 HTML 输出和RStudio. 我正在pandocget MathJaxfrom rawgit.org，因为默认的cdn.mathjax.org即将失效，而且似乎不再有Contrib带有扩展名的路径。

我尝试在扩展路径上添加带有变体的MathJax's ，但无济于事。这会导致 HTML 查找扩展名，但显然是在错误的位置：，这是一个.$\require{siunitx}$siunitxsiunitxhttps://cdn.rawgit.com/mathjax/MathJax/2.7.1/extensions/TeX/siunitx.js?V=2.7.1404

如果我删除\require{}并删除动态加载的输出 HTML 文件的部分MathJax（标记为<!-- dynamically load mathjax for compatibility with self-contained -->），然后手动添加：

<script type="text/x-mathjax-config">
  MathJax.Hub.Config({
    tex2jax: {inlineMath: [["$","$"],["\\(","\\)"]]},
  errorSettings: {message: undefined},
    TeX: { extensions: ["[burnpanck]/siunitx/unpacked/siunitx.js"] }
  };
  MathJax.Ajax.config.path['burnpanck']  = 
'https://rawgit.com/burnpanck/MathJax-third-party-extensions/master';
</script>
<script type="text/javascript" 
src="https://cdn.rawgit.com/mathjax/MathJax/2.7.1/latest.js?config=TeX-AMS-
MML_HTMLorMML"></script>

对于 HTML 文件的标头，它会短暂弹出有关某些问题的投诉，siunitx.js但会生成正确的输出（这是 MathJax 扩展示例中标头的修改版本siunitx，来自此处）

这表明我可以修改 HTML 模板以pandoc反映这些更改，并且基本上可以正常工作。

然而，仍然存在以下问题：

• 以这种方式更改 HTML 模板是修复 HTML 输出的正确方法吗？这些是现在要使用的 URL cdn.mathjax.org，还是应该使用更好的 URL？
• 为什么我仍然收到有关 的警告siunitx.js？
• 需要做什么才能Rstudio理解siunitx预览中的内容？是否已经有一种方法可以启用此功能（例如，说服它使用siunitx扩展，假设它是基于 构建的MathJax），或者这将是一个功能请求..？

事实上，如果有一种简单的方法来访问MathJax开箱即用的扩展，而不必费心编辑模板等，并在 GUI 中进行适当的处​​理，那就太好了Rstudio。我可以想象，可能有些Rstudio用户会从额外的功能中受益，但不想/无法跳过这些障碍来访问它。

更新由于 MathJax CDN 的更改，我在加载“工作”HTML 时看到的警告消息siunitx.js似乎是当前版本的普遍问题，请参阅此处提出的问题：https: //github.com/burnpanck/MathJax -第三方扩展/问题/5siunitx.js

Answer 1

I'm using includes in_header to solve the problem.

---
title: "doku1"
output:
  html_document:
    includes:
     in_header: header.html
  pdf_document:
    keep_tex: yes
    latex_engine: pdflatex
    number_sections: no
header-includes: \usepackage{mhchem, siunitx}
---

header.html looks like this

<script type="text/x-mathjax-config">
MathJax.Ajax.config.path["mhchem"] = "https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/mathjax-mhchem/3.3.2";
MathJax.Ajax.config.path['myExt']  = 'https://rawgit.com/burnpanck/MathJax-third-party-extensions/master';
MathJax.Hub.Config({
  TeX: { extensions: ["AMSmath.js","AMSsymbols.js","[myExt]/siunitx/unpacked/siunitx.js","[mhchem]/mhchem.js", "color.js"] }
  });
</script>

It works, but is rather slow.

John