jav*_*vid 5 python tf-idf k-means apache-spark
我正在尝试通过预处理、生成 tf-idf 矩阵,然后应用 K 均值来完成文本文档聚类的经典工作。但是,在经典 20NewsGroup 数据集上测试此工作流程会导致大多数文档聚集到一个集群中。(我最初尝试对 20 个组中的 6 个组中的所有文档进行聚类 - 因此希望聚类成 6 个簇)。
我正在 Apache Spark 中实现此功能,因为我的目的是在数百万个文档上利用此技术。以下是在 Databricks 上用 Pyspark 编写的代码:
#declare path to folder containing 6 of 20 news group categories
path = "/mnt/%s/20news-bydate.tar/20new-bydate-train-lessFolders/*/*" %
MOUNT_NAME
#read all the text files from the 6 folders. Each entity is an entire
document.
text_files = sc.wholeTextFiles(path).cache()
#convert rdd to dataframe
df = text_files.toDF(["filePath", "document"]).cache()
from pyspark.ml.feature import HashingTF, IDF, Tokenizer, CountVectorizer
#tokenize the document text
tokenizer = Tokenizer(inputCol="document", outputCol="tokens")
tokenized = tokenizer.transform(df).cache()
from pyspark.ml.feature import StopWordsRemover
remover = StopWordsRemover(inputCol="tokens",
outputCol="stopWordsRemovedTokens")
stopWordsRemoved_df = remover.transform(tokenized).cache()
hashingTF = HashingTF (inputCol="stopWordsRemovedTokens", outputCol="rawFeatures", numFeatures=200000)
tfVectors = hashingTF.transform(stopWordsRemoved_df).cache()
idf = IDF(inputCol="rawFeatures", outputCol="features", minDocFreq=5)
idfModel = idf.fit(tfVectors)
tfIdfVectors = idfModel.transform(tfVectors).cache()
#note that I have also tried to use normalized data, but get the same result
from pyspark.ml.feature import Normalizer
from pyspark.ml.linalg import Vectors
normalizer = Normalizer(inputCol="features", outputCol="normFeatures")
l2NormData = normalizer.transform(tfIdfVectors)
from pyspark.ml.clustering import KMeans
# Trains a KMeans model.
kmeans = KMeans().setK(6).setMaxIter(20)
km_model = kmeans.fit(l2NormData)
clustersTable = km_model.transform(l2NormData)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

ID number_of_documents_in_cluster
0 3024
3 5
1 3
5 2
2 2
4 1
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
正如你所看到的,我的大部分数据点都聚集到集群 0 中,而且我无法弄清楚我做错了什么,因为我在网上遇到的所有教程和代码都指向使用这种方法。
此外,我还尝试在 K 均值之前对 tf-idf 矩阵进行归一化,但这也会产生相同的结果。我知道余弦距离是一个更好的测量方法,但我预计在 Apache Spark 中使用标准 K 均值将提供有意义的结果。
任何人都可以帮忙确定我的代码中是否存在错误,或者我的数据集群管道中是否缺少某些内容?
先感谢您!
以下是 python 中的实现,即使具有大量最大特征,它也不会将所有文档分组在一起:
#imports
import pandas as pd
import os
import nltk
from nltk.tokenize import RegexpTokenizer
from nltk.corpus import stopwords
import numpy as np
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
from sklearn.cluster import KMeans, MiniBatchKMeans
vectorizer = TfidfVectorizer(max_features=200000, lowercase=True,
min_df=5, stop_words='english',
use_idf=True)
X = vectorizer.fit_transform(df['document'])
#Apply K-means to create cluster
from time import time
km = KMeans(n_clusters=20, init='k-means++', max_iter=20, n_init=1,
verbose=False)
km.fit(X)
#result
3 2634
6 1720
18 1307
15 780
0 745
1 689
16 504
8 438
7 421
5 369
11 347
14 330
4 243
13 165
10 136
17 118
9 113
19 106
12 87
2 62
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我本以为在 KMeans 中尝试余弦或 Jaccard 距离之前,我们可以使用 KMeans 和欧几里德距离在 pyspark 中复制类似的东西。有什么解决方案或意见吗?
小智 2
只是一些简短的评论:
这是我根据你的代码修改后可以运行的代码。警告:我根本没有调整它,所以集群目前几乎没有用(但它确实找到了不同的集群)。
df = spark.read.parquet("/databricks-datasets/news20.binary/data-001/training")
df.cache().count()
from pyspark.ml.feature import HashingTF, IDF, Tokenizer, CountVectorizer, StopWordsRemover
tokenizer = Tokenizer(inputCol="text", outputCol="tokens")
remover = StopWordsRemover(inputCol="tokens", outputCol="stopWordsRemovedTokens")
hashingTF = HashingTF(inputCol="stopWordsRemovedTokens", outputCol="rawFeatures", numFeatures=2000)
idf = IDF(inputCol="rawFeatures", outputCol="features", minDocFreq=5)
from pyspark.ml.clustering import KMeans
kmeans = KMeans(k=20)
from pyspark.ml import Pipeline
pipeline = Pipeline(stages=[tokenizer, remover, hashingTF, idf, kmeans])
model = pipeline.fit(df)
results = model.transform(df)
results.cache()
display(results.groupBy("prediction").count()) # Note "display" is for Databricks; use show() for OSS Apache Spark
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
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