Spark合并与收集,哪个更快?

Fra*_*ank 4 python apache-spark pyspark

我pyspark使用 AWS EMR 和 ~15 m4.large 核心来处理 50Gb 数据。

每行数据都包含一天中特定时间的一些信息。我使用以下for循环来提取和聚合每小时的信息。最后我是union数据,因为我希望将结果保存在一个csv 文件中。

# daily_df is a empty pyspark DataFrame
for hour in range(24):
    hourly_df = df.filter(hourFilter("Time")).groupby("Animal").agg(mean("weights"), sum("is_male"))
    daily_df = daily_df.union(hourly_df)
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据我所知,我必须执行以下操作才能强制pyspark.sql.Dataframe对象保存到 1 个 csv 文件(约 1Mb)而不是 100 多个文件:

daily_df.coalesce(1).write.csv("some_local.csv")
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似乎花了大约70分钟才能完成这个进度,我想知道我是否可以通过使用collect()类似的方法使其更快?

daily_df_pandas = daily_df.collect()
daily_df_pandas.to_csv("some_local.csv")
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zer*_*323 5

coalesce(1)一般来说, 和都很collect糟糕,但预期输出大小约为 1MB,这并不重要。它根本不应该成为这里的瓶颈。

一个简单的改进是删除loop-> filter->union并执行单个聚合:

df.groupby(hour("Time"), col("Animal")).agg(mean("weights"), sum("is_male"))
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spark.sql.shuffle.partitions如果这还不够,那么这里的问题很可能是配置(如果您还没有这样做,最好的起点可能是调整)。