GProf 输出中缺少函数

Kal*_*gin 4 c mpi gprof

我正在尝试分析一些 C 代码,但最直观地成本最高的函数之一并未出现在 GProf 输出中。

int main() {
    initialise...
    haloSwap();

    for(...) {
        functions...

        propagate();

        functions...
    }
}

void propagate() {
    for (x)
        for (y)
            for (z)
                grid[xNew][yNew][zNew] = grid[x][y][z];

    haloSwap();
}

void haloSwap() {
    // Horizontal swap
    create buffers...
    MPI_Sendrecv(buffers);
    recreate grid from buffers...

    // Vertical swap
    create buffers...
    MPI_Sendrecv(buffers);
    recreate grid from buffers...
}
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希望伪代码能够以某种方式解释设置。haloSwap()涉及线程之间的大量通信,我觉得这是算法中昂贵的部分。它在初始化期间被调用,然后在算法循环期间被重复调用。

GProf 仅显示 1 次调用haloSwap(在 init 期间),尽管我知道它从内部被调用了 1000 多次propagate()

propagate()显示为代码中最昂贵的部分,但我想知道它是 xyz 循环还是 MPI 通信。

haloSwap有谁知道为什么对from的调用propagate在调用次数和函数中花费的时间上似乎都被忽略了?

haloSwap是在另一个 .c 文件中定义的,这可能是一个因素?

如果我在调用后将 的调用haloSwap移至主循环propagate(而不是在其中),GProf 仍然只显示对其的 1 次调用。

Rob*_*ham 5

启用优化的分析绝对不是一个愚蠢的错误。相反,它是人们应该分析的方式——否则您将浪费时间和精力手动优化编译器本可以为您修复的例程。

如果您需要与 gprof 提供的不同的配置文件报告,那么google 性能工具(又名 gperftools)可能对您有用。报告将记录在内联函数中花费的时间。这是一个示例报告,您可以在其中看到谷歌工具如何报告内联函数:

% ~/soft/gperftools/bin/pprof --text \
    bigio_mpi bigio-profiling/prof-ca-fill-inline1-0.out| head -10
Using local file bigio_mpi.
Using local file bigio-profiling/prof-ca-fill-inline1-0.out.
Total: 29680 samples
10837  36.5%  36.5%    24056  81.1% ADIOI_P2PContigReadAggregation
3534  11.9%  48.4%     3534  11.9% _init@3a858
2954  10.0%  58.4%     2954  10.0% unshuffle_sse2
2448   8.2%  66.6%     2448   8.2% __memcpy_ssse3
1742   5.9%  72.5%     2661   9.0% type_create_contiguous_x (inline)
1373   4.6%  77.1%     1373   4.6% shuffle_sse2
1176   4.0%  81.1%     6205  20.9% ADIOI_Type_create_hindexed_x
1104   3.7%  84.8%    19082  64.3% ADIOI_Get_eof_offset
831   2.8%  87.6%    28184  95.0% ADIOI_Flatten
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