Rqc 包错误：“找不到 GhostScript”

Question

我正在关注Rqc 包文档，所以我输入了以下内容：

library(Rqc)
folder <- system.file(package = "ShortRead", "extdata/E-MTAB-1147")
rqc(path = folder, pattern = ".fastq.gz")

但我收到以下错误：

位图错误（文件 = 文件名，宽度 = 宽度，高度 = 高度，res = 300）：找不到 GhostScript

Answer 1

我正在运行最新版本的 RStudio (0.99.491)。首先，确保您已下载 GhostScript（此处）。然后，转到安装它的目录，并找到可执行文件的路径。然后，这样做：

Sys.setenv(R_GSCMD="C:/Program Files/gs/gs9.18/bin/gswin64c.exe")

路径是指我的特定 .exe，所以你的可能不同。基本上，抛出错误的函数正在寻找为其R_GSCMD提供运行 GhostScript 的路径。它没有找到，所以它抛出了一个错误。通过设置R_GSCMD路径，它现在知道去哪里找。