我正在使用HDF5DotNet编写通用数据记录API .我们的想法是使用反射来自动创建包含字段的H5复合数据类型.然后,用户可以使用方法轻松地将数据添加到数据日志中.DataLog<T>Twrite(T[] data)
为了自动创建H5类型,必须用[StructLayoutAttribute]一些字段或一些字段来装饰类或结构[MarshalAsAttribute].然后将每个字段映射到H5类型并添加到H5复合数据类型.包含枚举或其他用户定义的结构的类型有点复杂,但它们仍然有效.
从我在网上找到的例子中,我成功地创建了H5 Type,创建了一个数据集并为struct我创建的简单数据添加了一些数据.
当我从一个类型更改时我的问题struct的class.仍然创建了H5Type并且没有抛出异常,但是当我在HDF View中打开文件时,我可以看到正确的字段,但数据是垃圾.
我怀疑问题出现是因为在C#结构中是值类型而类是引用类型.我使用以下代码来确定数据的基础结构是什么样的:
public static byte[] GetBytes(dynamic obj)
{
var size = Marshal.SizeOf(obj);
// Both managed and unmanaged buffers required.
var bytes = new byte[size];
var ptr = Marshal.AllocHGlobal(size);
// Copy object byte-to-byte to unmanaged memory.
Marshal.StructureToPtr(obj, ptr, false);
// Copy data from unmanaged memory to managed buffer.
Marshal.Copy(ptr, bytes, 0, size);
// Release unmanaged memory.
Marshal.FreeHGlobal(ptr);
return bytes;
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
事实证明,无论我使用a class还是a struct,字节数和它们的顺序都与此函数完全相同.
作为参考(因为网上没有很多代码示例),我将提供我的代码以附加到现有数据集:
public static void AppendToDataSet<DataType>(H5DataSetId dataSetId, DataType[] data)
{
if (data.Length < 1)
{
return;
}
var dataSpaceId = H5D.getSpace(dataSetId);
var rank = H5S.getSimpleExtentNDims(dataSpaceId);
var dims = H5S.getSimpleExtentDims(dataSpaceId);
var rank_chunk = new long[] { };
var prop = H5D.getCreatePropertyList(dataSetId);
if (H5P.getLayout(prop) == H5D.Layout.CHUNKED)
{
rank_chunk = H5P.getChunk(prop, rank);
}
var dims_extended = new long[] { dims[0] + data.Length }; // the new data set size
/* Extend the dataset */
H5D.setExtent(dataSetId, dims_extended);
/* Select a hyperslab in extended portion of dataset */
H5S.selectHyperslab(dataSpaceId, H5S.SelectOperator.SET, new long[] { dims[0] }, new long[] { data.Length });
/* Define memory space */
var memspace = H5S.create_simple(rank, dims_extended);
/* Convert to HDF data */
var hdf_data = new H5Array<DataType>(data);
/* Write the data to the extended portion of dataset */
var dataTypeId = H5D.getType(dataSetId);
H5D.write(dataSetId,
dataTypeId,
hdf_data);
}
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我希望能够为此使用类,因为使用结构需要对应用程序的其余部分进行重大的结构更改.有谁知道为什么H5写作不适合课程以及我能解决的任何方式?
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