xargs:在并行模式下将stdout重定向到文件时丢失输出

Question

我在并行模式下使用GNU xargs(版本4.2.2),当重定向到文件时,我似乎可靠地丢失输出.重定向到管道时,它似乎正常工作.

以下shell命令演示了该问题的最小,完整和可验证的示例.我生成了2550个数字,xargs用于将它分成100个args的行,每行总共26行,其中第26行只包含50个args.

# generate numbers 1 to 2550 where each number is on its own line
$ seq 1 2550 > /tmp/nums
$ wc -l /tmp/nums
2550 /tmp/nums

# piping to wc is accurate: 26 lines, 2550 args
$ xargs -P20 -n 100 </tmp/nums | wc
     26    2550   11643

# redirecting to a file is clearly inaccurate: 22 lines, 2150 args
$ xargs -P20 -n 100 </tmp/nums >/tmp/out; wc /tmp/out
     22  2150 10043 /tmp/out

我认为问题与底层shell无关,因为shell将在命令执行之前执行重定向并等待xargs完成.在这种情况下,我假设xargs在刷新缓冲区之前完成.但是,如果我的假设是正确的,我不知道为什么在写入管道时这个问题不会出现.

编辑:

>>在shell中使用(创建/附加到文件)时出现,问题似乎没有显现:

# appending to file
$ >/tmp/out
$ xargs -P20 -n 100 </tmp/nums >>/tmp/out; wc /tmp/out
     26    2550   11643

# creating and appending to file
$ rm /tmp/out
$ xargs -P20 -n 100 </tmp/nums >>/tmp/out; wc /tmp/out
     26    2550   11643

Answer 1

您的问题是由于不同进程的输出混合所致。如下所示：

parallel perl -e '\$a=\"1{}\"x10000000\;print\ \$a,\"\\n\"' '>' {} ::: a b c d e f
ls -l a b c d e f
parallel -kP4 -n1 grep 1 > out.par ::: a b c d e f
echo a b c d e f | xargs -P4 -n1 grep 1 > out.xargs-unbuf
echo a b c d e f | xargs -P4 -n1 grep --line-buffered 1 > out.xargs-linebuf
echo a b c d e f | xargs -n1 grep 1 > out.xargs-serial
ls -l out*
md5sum out*

解决方案是缓冲每个作业的输出 - 无论是在内存中还是在 tmpfiles 中（就像 GNU Parallel 所做的那样）。