AWS S3的Sklearn Joblib加载功能IO错误

Jas*_*ine 4 python amazon-s3 pickle scikit-learn joblib

我正在尝试从sklearn-learn加载我的分类器的pkl转储。

对于我的对象,joblib转储的压缩效果比cPickle转储的压缩效果好得多,因此我希望坚持使用它。但是,尝试从AWS S3读取对象时出现错误。

情况:

  • 本地托管的PKL对象:pickle.load有效,joblib.load有效
  • 使用应用程序将Pkl对象推送到Heroku(从静态文件夹加载):pickle.load有效,joblib.load有效
  • 将pkl对象推送到S3:pickle.load有效,joblib.load返回IOError。(通过heroku应用进行测试,并通过本地脚本进行测试)

请注意,joblib和pickle的pkl对象是使用各自方法转储的不同对象。(即joblib仅加载joblib.dump(obj),而pickle仅加载cPickle.dump(obj)。

Joblib vs cPickle代码

# case 2, this works for joblib, object pushed to heroku
resources_dir = os.getcwd() + "/static/res/" # main resource directory
input = joblib.load(resources_dir + 'classifier.pkl')

# case 3, this does not work for joblib, object hosted on s3
aws_app_assets = "https://%s.s3.amazonaws.com/static/res/" % keys.AWS_BUCKET_NAME
classifier_url_s3 = aws_app_assets + 'classifier.pkl'

# does not work with raw url, IO Error
classifier = joblib.load(classifier_url_s3)

# urrllib2, can't open instance
# TypeError: coercing to Unicode: need string or buffer, instance found
req = urllib2.Request(url=classifier_url_s3)
f = urllib2.urlopen(req)
classifier = joblib.load(urllib2.urlopen(classifier_url_s3))

# but works with a cPickle object hosted on S3
classifier = cPickle.load(urllib2.urlopen(classifier_url_s3))
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我的应用程序在情况2下可以正常工作,但是由于加载速度很慢,我想尝试将所有静态文件(尤其是这些pickle dumps)推送到S3。Joblib加载与Pickle加载的方式之间固有的差异会导致此错误吗?

这是我的错误

File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/sklearn/externals/joblib/numpy_pickle.py", line 409, in load
with open(filename, 'rb') as file_handle:
IOError: [Errno 2] No such file or directory: classifier url on s3
[Finished in 0.3s with exit code 1]
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

这不是权限问题,因为我已将s3上的所有对象公开进行测试,并且pickle.dump对象可以正常加载。如果我直接将URL输入浏览器,joblib.dump对象也会下载

我可能会完全错过一些东西。

谢谢。

vol*_*myr 5

joblib.load()需要文件系统上存在的文件名。

Signature: joblib.load(filename, mmap_mode=None)
Parameters
-----------
filename: string
    The name of the file from which to load the object
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

而且,即使您不介意腌制的模型可以被世界使用,将所有资源公开都可能不是其他资产的好主意。

首先将对象从S3复制到工作人员的本地文件系统非常简单:

from boto.s3.connection import S3Connection
from sklearn.externals import joblib
import os

s3_connection = S3Connection(AWS_ACCESS_KEY_ID, AWS_SECRET_ACCESS_KEY)
s3_bucket = s3_connection.get_bucket(keys.AWS_BUCKET_NAME)
local_file = '/tmp/classifier.pkl'
s3_bucket.get_key(aws_app_assets + 'classifier.pkl').get_contents_to_filename(local_file)
clf = joblib.load(local_file)
os.remove(local_file)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

希望这会有所帮助。

PS可以使用这种方法来腌制整个sklearn管道。这也包括特征插补。只是要注意训练和预测之间库的版本冲突。