尝试导入skbio模块时找不到future.utils.six

Question

我刚刚使用pip3安装了numpy和scikit-bio.如果我在交互式会话中导入DNASequence,我会收到一条错误消息:

>>> from skbio.sequence import DNASequence
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/local/lib/python3.4/site-packages/skbio/__init__.py", line 64, in <module>
    from skbio.stats.distance import DistanceMatrix
  File "/usr/local/lib/python3.4/site-packages/skbio/stats/distance/__init__.py", line 293, in <module>
    from ._base import (DissimilarityMatrixError, DistanceMatrixError,
  File "/usr/local/lib/python3.4/site-packages/skbio/stats/distance/_base.py", line 11, in <module>
    from future.utils.six import StringIO, string_types
ImportError: No module named 'future.utils.six'

运行'pip3 list'向我显示安装了六个1.8.0.更奇怪的是,如果我重复import语句,DNASequence会正确加载.知道是什么导致了这种行为吗？

我正在运行Mac OS X 10.9.5(Mavericks),Python 3.4.1(通过自制软件安装).

Answer 1

这是版本 0.14.0 中软件包更改的问题future（删除了future.utils.six，如此处所述）。

我们已在 scikit-bio 的开发版本中修复了此问题，但与此同时，您可以在发布版本中再次使用此问题，如下所示：

pip uninstall future pip install future==0.13.1

如果您有兴趣，请参阅此处以获取有关该问题的更多讨论。