为什么scipy.cluster.hierarchy.linkage需要一个指标？

Question

我们需要通过距离矩阵,所以不需要计算任何额外的距离,对吗？我错过了什么？

这里的文档:http://docs.scipy.org/doc/scipy-0.14.0/reference/generated/scipy.cluster.hierarchy.linkage.html

Answer 1

该linkage函数不需要metric参数，除非您传递原始观察结果而不是距离矩阵。

从您发布的链接

y : ndarray
[...] 或者，n 维 m 个观察向量的集合可以作为 m × n 数组传递。

该linkage函数检查您是否传入了有效的距离矩阵 - 可能使用is_valid_y/ is_valid_dm- 如果没有，它将首先应用pdist您指定的度量（如果未指定任何值，则应用欧几里德度量）。