我是热图的新手。我的数据看起来像:
Dat A B C D E
A 100 30.3 0 55.71 45.78
B 12.85 100 72.85 12.64 98.51
C 0 27.85 100 82.28 3.07
D 23.71 30.64 40.28 100 6.33
E 25.25 85 52.36 36.33 100
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
代码:
pdf("hh.pdf")
library(gplots)
data = read.table("file.txt", header=T, row.names=1)
heatmap.2(as.matrix(data))
dev.off()
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当我使用上述数据绘制热图时,可以使用这些网格线。但是当我将行数设为 100 或在该范围内时,情节几乎不可见。地块上覆盖着短划线垂直线。
我想摆脱那些烦人的线条。我已经保存了.png格式,但同样,我得到了相同的行。
我已经检查了heatmap.2(gplots 包) - 如何删除某些单元格中烦人的线条?
使用 R 3.0.2
pdf("hh.pdf")
library(gplots)
data = read.table(text="Dat A B C D E
A 100 30.3 0 55.71 45.78
B 12.85 100 72.85 12.64 98.51
C 0 27.85 100 82.28 3.07
D 23.71 30.64 40.28 100 6.33
E 25.25 85 52.36 36.33 100", header=T, row.names=1)
heatmap.2(as.matrix(data), tracecol=NA)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)