另一种选择：cut -d <string>?

Question

当我输入时ls我得到：

aedes_aegypti_upstream_dremeready_all_simpleMasked_random.fasta
anopheles_albimanus_upstream_dremeready_all_simpleMasked_random.fasta
anopheles_arabiensis_upstream_dremeready_all_simpleMasked_random.fasta
anopheles_stephensi_upstream_dremeready_all_simpleMasked_random.fasta
culex_quinquefasciatus_upstream_dremeready_all_simpleMasked_random.fasta

我想将其通过管道传输到 cut （或通过某种替代方式），以便我只得到：

aedes_aegypti
anopheles_albimanus
anopheles_arabiensis
anopheles_stephensi
culex_quinquefasciatus

如果 cut 接受一个字符串（多个字符）作为分隔符，那么我可以使用：

cut -d "_upstream_" -f1

但这是不允许的，因为 cut 只采用单个字符作为分隔符。

Answer 1

awk允许使用字符串作为分隔符：

$ awk -F"_upstream_" '{print $1}' file
aedes_aegypti
anopheles_albimanus
anopheles_arabiensis
anopheles_stephensi
culex_quinquefasciatus
drosophila_melanogaster

请注意，对于给定的输入，您还可以使用cutwith_作为分隔符并打印前两条记录：

$ cut -d'_' -f-2 file
aedes_aegypti
anopheles_albimanus
anopheles_arabiensis
anopheles_stephensi
culex_quinquefasciatus
drosophila_melanogaster

sed并且grep也能做到。例如，这grep使用前瞻打印从行开头开始的所有内容，直到找到_upstream：

$ grep -Po '^\w*(?=_upstream)' file
aedes_aegypti
anopheles_albimanus
anopheles_arabiensis
anopheles_stephensi
culex_quinquefasciatus
drosophila_melanogaster