tcsh：foreach 命令在终端中工作正常，但从 tcsh 脚本文件调用时不起作用

Question

有关问题的简化版本，请先阅读下面的 Update1。

我已经制作了一个 tcsh 文件，以将其运行的文件夹中所有文件/文件夹的列表保存到一个文件中（我正在处理一个神经影像项目，我的文件夹 RawData 包含许多主题，每个主题都有一个文件夹；我编写了这个文件 genSubjList.tcsh 来将主题列表保存到文件 subjList.txt）。文件里面的代码是：

foreach subj (*)
    echo $subj >> subjList.txt
end

当我切换到终端中的 RawData 目录并在终端中编写这段代码时，它会毫无问题地生成主题列表，但是当我使用 source 命令调用 genSubjList.tcsh 时：

source ../scripts/genSubjList.tcsh

它只是将 RawData 中第一个文件夹（主题）的名称写入 subjList.txt；我已经使用 chmode +x 使 genSubjList.tcsh 可执行（“scripts”文件夹位于 RawData 的父文件夹中，包含 genSubjList.tcsh）

我在终端内运行代码时的输出是文件 subjList.txt，其中包含：

主题 1 主题 2 主题 3 。. . 主题 n

当我使用 source ../scripts/genSubjLits.tcsh 运行代码时的输出是文件 subjList.txt 包含：

主题 1

我将非常感谢任何帮助找出我犯错的地方。谢谢！

关于为什么我想弄清楚问题所在的附加说明：

问题不仅仅是生成一个主题列表；我想了解为什么这个 tcsh 脚本不起作用，因为主要问题是我使用 FreeSurfer (surfer.nmr.mgh.harvard.edu) 来分析许多主题；我想并行分析它们，所以我开发了一些脚本来将主题分成 5 个组（存储在 5 个名为 subjList1.txt .. subjList5.txt 的文件中，每个文件都有多个主题）。然后，我想在 5 个终端中并行运行以下代码：

foreach subj (`cat subjList1.txt`)
    echo $subj
    recon-all -i $RAW_DATA/$subj/T1/*0001.dcm -subject $subj -all
end

其中 subjList1.txt 被 subjList2、3 等替换为并行终端；recon-all 线对每个主题进行分析。同样，当我在终端中运行这段代码时，每个 subjList 中的所有主题都会被分析，但是当我将同一段代码保存在多个脚本文件（recon1.tcsh .. recon5.tcsh）中并使用：

source recon1.tcsh

只分析每个 subjList 中的第一个主题。

更新1：

有趣的是，如果这个简单的循环：

foreach i (1 2 3 4 5)
    echo $i
end

存储在文件 loop.tcsh 中，并使用以下方法调用：

source loop.tcsh

输出将仅为 1，这意味着它仅通过循环的第一轮。

BASH中不存在同样的问题；如果这个循环：

for i in {1..5} ; do
    echo $i
done

存储在文件 loop2.bash 中并使用以下方法调用：

source loop2.bash

它可以毫无问题地工作！

更新2：

BASH中不存在该问题；如果此代码：

for subj in * ; do
    echo $subj >> subjList.txt
done

存储在文件 genSubjList.bash 中并使用以下方法调用：

source ../scripts/genSubjList.bash

在bash环境中，它生成主题列表没有任何问题！

Answer 1

我知道这很旧，但我遇到了这个，因为我刚才遇到了同样的问题，我自己解决了。

我在 tcsh foreach 脚本中的“结束”之后添加了一个空行，它运行良好。在此之前，它只会遍历列表中的第一项，然后停止。Bash 脚本对我来说很好用，就像原始海报一样。为什么空行很重要？