lys*_*ard 14 parallel-processing profiling haskell quicksort
我有这个看似琐碎的并行快速实现,代码如下:
import System.Random
import Control.Parallel
import Data.List
quicksort :: Ord a => [a] -> [a]
quicksort xs = pQuicksort 16 xs -- 16 is the number of sparks used to sort
-- pQuicksort, parallelQuicksort
-- As long as n > 0 evaluates the lower and upper part of the list in parallel,
-- when we have recursed deep enough, n==0, this turns into a serial quicksort.
pQuicksort :: Ord a => Int -> [a] -> [a]
pQuicksort _ [] = []
pQuicksort 0 (x:xs) =
let (lower, upper) = partition (< x) xs
in pQuicksort 0 lower ++ [x] ++ pQuicksort 0 upper
pQuicksort n (x:xs) =
let (lower, upper) = partition (< x) xs
l = pQuicksort (n `div` 2) lower
u = [x] ++ pQuicksort (n `div` 2) upper
in (par u l) ++ u
main :: IO ()
main = do
gen <- getStdGen
let randints = (take 5000000) $ randoms gen :: [Int]
putStrLn . show . sum $ (quicksort randints)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我编译
ghc --make -threaded -O2 quicksort.hs
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并运行
./quicksort +RTS -N16 -RTS
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无论我做什么,我都无法让它比在一个cpu上运行的简单顺序实现运行得更快.
编辑:@tempestadept暗示快速排序自己是问题.为了检查这一点,我实现了一个简单的合并排序,其精神与上面的例子相同.它具有相同的行为,您添加的功能越多,执行速度越慢.
import System.Random
import Control.Parallel
splitList :: [a] -> ([a], [a])
splitList = helper True [] []
where helper _ left right [] = (left, right)
helper True left right (x:xs) = helper False (x:left) right xs
helper False left right (x:xs) = helper True left (x:right) xs
merge :: (Ord a) => [a] -> [a] -> [a]
merge xs [] = xs
merge [] ys = ys
merge (x:xs) (y:ys) = case x<y of
True -> x : merge xs (y:ys)
False -> y : merge (x:xs) ys
mergeSort :: (Ord a) => [a] -> [a]
mergeSort xs = pMergeSort 16 xs -- we use 16 sparks
-- pMergeSort, parallel merge sort. Takes an extra argument
-- telling how many sparks to create. In our simple test it is
-- set to 16
pMergeSort :: (Ord a) => Int -> [a] -> [a]
pMergeSort _ [] = []
pMergeSort _ [a] = [a]
pMergeSort 0 xs =
let (left, right) = splitList xs
in merge (pMergeSort 0 left) (pMergeSort 0 right)
pMergeSort n xs =
let (left, right) = splitList xs
l = pMergeSort (n `div` 2) left
r = pMergeSort (n `div` 2) right
in (r `par` l) `pseq` (merge l r)
ris :: Int -> IO [Int]
ris n = do
gen <- getStdGen
return . (take n) $ randoms gen
main = do
r <- ris 100000
putStrLn . show . sum $ mergeSort r
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已经提到了几个问题:
massiv而不是列表的实现。scheduler-- A helper function that partitions a region of a mutable array.
unstablePartitionRegionM ::
forall r e m. (Mutable r Ix1 e, PrimMonad m)
=> MArray (PrimState m) r Ix1 e
-> (e -> Bool)
-> Ix1 -- ^ Start index of the region
-> Ix1 -- ^ End index of the region
-> m Ix1
unstablePartitionRegionM marr f start end = fromLeft start (end + 1)
where
fromLeft i j
| i == j = pure i
| otherwise = do
x <- A.unsafeRead marr i
if f x
then fromLeft (i + 1) j
else fromRight i (j - 1)
fromRight i j
| i == j = pure i
| otherwise = do
x <- A.unsafeRead marr j
if f x
then do
A.unsafeWrite marr j =<< A.unsafeRead marr i
A.unsafeWrite marr i x
fromLeft (i + 1) j
else fromRight i (j - 1)
{-# INLINE unstablePartitionRegionM #-}
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这是实际的现场快速排序
quicksortMArray ::
(Ord e, Mutable r Ix1 e, PrimMonad m)
=> Int
-> (m () -> m ())
-> A.MArray (PrimState m) r Ix1 e
-> m ()
quicksortMArray numWorkers schedule marr =
schedule $ qsort numWorkers 0 (unSz (msize marr) - 1)
where
qsort n !lo !hi =
when (lo < hi) $ do
p <- A.unsafeRead marr hi
l <- unstablePartitionRegionM marr (< p) lo hi
A.unsafeWrite marr hi =<< A.unsafeRead marr l
A.unsafeWrite marr l p
if n > 0
then do
let !n' = n - 1
schedule $ qsort n' lo (l - 1)
schedule $ qsort n' (l + 1) hi
else do
qsort n lo (l - 1)
qsort n (l + 1) hi
{-# INLINE quicksortMArray #-}
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现在,如果我们看一下参数numWorkers,schedule它们是非常不透明的。假设如果提供1第一个参数和id第二个参数,我们将只具有顺序快速排序,但是如果我们有一个可用的函数可以安排要同时计算的每个任务,那么我们将得到一个并行实现一个快速排序。幸运地为我们massiv提供了开箱即用的功能withMArray:
withMArray ::
(Mutable r ix e, MonadUnliftIO m)
=> Array r ix e
-> (Int -> (m () -> m ()) -> MArray RealWorld r ix e -> m a)
-> m (Array r ix e)
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这是一个纯版本,它将复制一个数组,然后使用数组本身内指定的计算策略将其按位置排序:
quicksortArray :: (Mutable r Ix1 e, Ord e) => Array r Ix1 e -> Array r Ix1 e
quicksortArray arr = unsafePerformIO $ withMArray arr quicksortMArray
{-# INLINE quicksortArray #-}
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最好的部分是基准。结果顺序:
vector-algorithmsC,我从这个问题中抢了下来massivbenchmarking QuickSort/Vector Algorithms
time 101.3 ms (93.75 ms .. 107.8 ms)
0.991 R² (0.974 R² .. 1.000 R²)
mean 97.13 ms (95.17 ms .. 100.2 ms)
std dev 4.127 ms (2.465 ms .. 5.663 ms)
benchmarking QuickSort/Vector
time 89.51 ms (87.69 ms .. 91.92 ms)
0.999 R² (0.997 R² .. 1.000 R²)
mean 92.67 ms (91.54 ms .. 94.50 ms)
std dev 2.438 ms (1.468 ms .. 3.493 ms)
benchmarking QuickSort/C
time 88.14 ms (86.71 ms .. 89.41 ms)
1.000 R² (0.999 R² .. 1.000 R²)
mean 90.11 ms (89.17 ms .. 93.35 ms)
std dev 2.744 ms (387.1 ?s .. 4.686 ms)
benchmarking QuickSort/Array
time 76.07 ms (75.77 ms .. 76.41 ms)
1.000 R² (1.000 R² .. 1.000 R²)
mean 76.08 ms (75.75 ms .. 76.28 ms)
std dev 453.7 ?s (247.8 ?s .. 699.6 ?s)
benchmarking QuickSort/Array Par
time 25.25 ms (24.84 ms .. 25.61 ms)
0.999 R² (0.997 R² .. 1.000 R²)
mean 25.13 ms (24.80 ms .. 25.75 ms)
std dev 991.6 ?s (468.5 ?s .. 1.782 ms)
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基准正在排序1,000,000个随机数Int64。如果您想查看完整的代码,可以在这里找到:https : //github.com/lehins/haskell-quicksort
总结起来,我们在四核处理器和8种功能上的速度提高了x3,这对我来说听起来不错。谢谢这个问题,现在我可以将排序功能添加到massiv;)
我不确定它对于惯用的快速排序是否能很好地起作用,但是对于真正的命令式快速排序,它可以(在某种程度上较弱)工作,如Roman在Sparking Imperatives中显示的那样。
不过,他从来没有取得过不错的提速。这确实需要一个真正的工作窃取双端队列,并且不会像火花队列那样溢出以正确优化。
鉴于@lehins 的出色回答,我不确定这是否值得注意,但是......
pQuickSort不起作用你的有两个大问题pQuickSort。第一个是您正在使用System.Random,它非常慢并且与并行排序的交互很奇怪(见下文)。第二个是你par u l引发计算来评估:
u = [x] ++ pQuicksort (n `div` 2) upper
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到 WHNF,即u = x : UNEVALUATED_THUNK,所以你的火花没有做任何实际的工作。
事实上,在并行化朴素的、非就地的伪快速排序时,不难观察到性能的提高。如前所述,一个重要的考虑因素是避免使用System.Random. 通过快速 LCG,我们可以对实际排序时间进行基准测试,而不是排序和随机数生成的某种奇怪的混合。以下伪快速排序:
import Data.List
qsort :: Ord a => [a] -> [a]
qsort (x:xs)
= let (a,b) = partition (<=x) xs
in qsort a ++ x:qsort b
qsort [] = []
randomList :: Int -> [Int]
randomList n = take n $ tail (iterate lcg 1)
where lcg x = (a * x + c) `rem` m
a = 1664525
c = 1013904223
m = 2^32
main :: IO ()
main = do
let randints = randomList 5000000
print . sum $ qsort randints
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当使用 GHC 8.6.4 和 编译时-O2,运行时间约为 9.7 秒。以下“并行”版本:
qsort :: Ord a => [a] -> [a]
qsort (x:xs)
= let (a,b) = partition (<=x) xs
a' = qsort a
b' = qsort b
in (b' `par` a') ++ x:b'
qsort [] = []
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编译后,ghc -O2 -threaded一项功能的运行时间约为 11.0 秒。添加+RTS -N4,运行时间为 7.1 秒。
哒哒!一种提升。
(相比之下,System.Random非并行版本的版本在一项功能上运行时间约为 13 秒,并行版本的运行时间约为 12 秒(可能只是因为一些小的严格性改进),并且每添加一个附加功能就会显着减慢;时间也不稳定,尽管我不太清楚为什么。)
partition此版本的一个明显问题是,即使并行a' = qsort a运行b' = qsort b,它们也与同一个顺序partition调用相关联。将其分为两个过滤器:
qsort :: Ord a => [a] -> [a]
qsort (x:xs)
= let a = qsort $ filter (<=x) xs
b = qsort $ filter (>x) xs
in b `par` a ++ x:b
qsort [] = []
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我们使用 来将速度加快到大约 5.5 秒-N4。公平地说,即使是非并行版本实际上也稍微快一些,用 2filters代替调用partition,至少在排序时是这样Ints。与分区相比,过滤器可能还可以进行一些额外的优化,这使得额外的比较值得。
现在,您在上面尝试做的pQuickSort是将并行计算限制为最顶层的递归集。让我们使用以下内容psort来进行实验:
psort :: Ord a => Int -> [a] -> [a]
psort n (x:xs)
= let a = psort (n-1) $ filter (<=x) xs
b = psort (n-1) $ filter (>x) xs
in if n > 0 then b `par` a ++ x:b else a ++ x:b
psort _ [] = []
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这将使n递归的顶层并行化。我的特定 LCG 示例的种子为 1(即iterate lcg 1),递归最多 54 层,因此psort 55除了跟踪层的开销之外,应该具有与完全并行版本相同的性能。当我运行它时,我得到的时间约为 5.8 秒-N4,因此开销相当小。
现在,看看当我们减少层数时会发生什么:
| Layers | 55 | 40 | 30 | 20 | 10 | 5 | 3 | 1 |
|--------+-----+-----+-----+-----+-----+-----+-----+------|
| time | 5.5 | 5.6 | 5.7 | 5.4 | 7.0 | 8.9 | 9.8 | 10.2 |
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请注意,在最低层,并行计算几乎没有什么好处。这主要是因为树的平均深度可能约为 25 层左右,因此只有少数 50 层的计算,其中很多都有奇怪的、不平衡的分区,而且它们肯定太小而无法并行化。另一方面,这些额外的par调用似乎不会受到任何惩罚。
同时,增益一直增加到至少 20 层,因此尝试人为地将火花总数限制为 16(例如,顶部 4 或 5 层)是一个很大的损失。