GGplot Barplot不接受Y值？

Question

我有一个数据帧:

>picard
count    reads
 1    20681318
 2     3206677
 3      674351
 4      319173
 5      139411
 6      117706

如何在ggplot(barplot)上绘制log10(计数)与log10(读数)？

我试过了:

ggplot(picard) + geom_bar(aes(x=log10(count),y=log10(reads)))

但它不接受y = log10(读取).如何绘制y值？

Answer 1

你可以做这样的事情,但是用log10刻度绘制不连续的x轴对我来说没有意义:

ggplot(picard) +
    geom_bar(aes(x=count,y=reads),stat="identity") +
    scale_y_log10() +
    scale_x_log10()

如果您只想要一个带有log10比例的y轴,只需执行以下操作:

ggplot(picard) +
    geom_bar(aes(x=count,y=reads),stat="identity") +
    scale_y_log10()

Answer 2

使用stat="identity"：

ggplot(picard) + geom_bar(aes(x=log10(count),y=log10(reads)), stat="identity")

实际上，您的方法会收到警告：

将变量映射到 y 并使用 stat="bin"。使用 stat="bin"，它将尝试将 y 值设置为每组中的案例数。这可能会导致意外行为，并且在 ggplot2 的未来版本中将不允许。如果您希望 y 代表个案计数，请使用 stat="bin" 并且不要将变量映射到 y。如果您希望 y 代表数据中的值，请使用 stat="identity"。有关示例，请参阅 ?geom_bar。（已弃用；最后使用于版本 0.9.2）