使用带有自定义临时目录的 install.packages

Question

我想安装一个具有安全配置文件的包，该包无权访问/tmp，但有自己的临时目录，例如/tmp/jeroen. 但是，即使我尝试传递TMPDIR环境变量，它仍然失败，因为它尝试使用/tmp. 下面是使用RAppArmor和unixtools的玩具示例（有关测试配置文件，请参见此处）

> library(RAppArmor)
> library(unixtools)

> dir.create("/tmp/jeroen")
> set.tempdir("/tmp/jeroen")
> setwd(tempdir());

> aa_change_profile("r-test")
Switching profiles...

> print(tempdir());
[1] "/tmp/jeroen"

> install.packages("plyr", lib="/tmp/jeroen", configure.vars="TMPDIR=/tmp/jeroen")
trying URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/plyr_1.8.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 384462 bytes (375 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 375 Kb

Fatal error: cannot create 'R_TempDir'

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/jeroen/downloaded_packages’

在查看kern.log文件（记录安全消息）时，发现问题在于R CMD INSTALL仍然尝试使用/tmp被拒绝的文件：

Jul 24 19:41:34 Jeroen-Antec kernel: [16270.696805] type=1400 audit(1374687694.097:599):
apparmor="DENIED" operation="mkdir" parent=5798 profile="r-test" name="/tmp/RtmpcUOJuQ/"
pid=5802 comm="R" requested_mask="c" denied_mask="c" fsuid=1000 ouid=1000

有什么办法，我可以告诉R CMD INSTALL使用/tmp/jeroen呢？

Answer 1

@hadley 在评论中给出了正确的答案：为了确保install.packages使用自定义临时目录，需要执行以下操作

Sys.setenv(TMPDIR="/tmp/jeroen")

此外：

configure.vars="TMPDIR=/tmp/jeroen"

这样，包的提取和安装都可以避免使用系统或用户默认的临时目录。