eri*_*mjl 1 python sorting list dna-sequence
非常感谢SO社区帮助我解决了以前遇到的问题.喜欢这里的帮助!
我现在还有另一个问题.我有一个单独的DNA序列列表,其中包含"构造编号"和"部件号".就目前的情况而言,从我之前的代码开始,我把它作为一个csv文件,我打开,读入,导入为字典对象列表.所有内容都按"构造编号"排序,但我需要按"零件编号"排序.(有点像在Excel中,他们说"首先排序" 然后排序 _."
有人知道如何完成这项工作吗?到目前为止,我所写的都是这样的:
primers_list = open('primers-list.csv', 'rU')
primers_unsorted = csv.DictReader(primers_list)
for row in primers_unsorted:
print(row)
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到目前为止,输出的一个子集就是以下内容,用于可视化我正在使用的数据:
{' Direction': 'fw primer', ' Construct Number': '1', ' Part Number': '2', 'Primer Sequence': 'AAGCGGCCGCTCGAGTCTAAgctcactcaaaggcggtaatcagataaaaaaaatccttag'}
{' Direction': 're primer', ' Construct Number': '1', ' Part Number': '1', 'Primer Sequence': 'attaccgcctttgagtgagcTTAGACTCGAGCGGCCGCTTTTTGACACCAGACCAACTGG'}
{' Direction': 'fw primer', ' Construct Number': '1', ' Part Number': '1', 'Primer Sequence': 'TTTAATTACTAACTTTATCTATGATAGATCCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAA'}
{' Direction': 're primer', ' Construct Number': '1', ' Part Number': '2', 'Primer Sequence': 'AAAACGACGGGATCTATCATAGATAAAGTTAGTAATTAAACTTAAAAGTTGTTTAATGTC'}
{' Direction': 'fw primer', ' Construct Number': '2', ' Part Number': '2', 'Primer Sequence': 'gtaaatccaagttgtaataatactagagTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTC'}
{' Direction': 're primer', ' Construct Number': '2', ' Part Number': '1', 'Primer Sequence': 'GGGGTTATGCTActctagtattattacaacttggatttaccacctttcttcgccttgatc'}
{' Direction': 'fw primer', ' Construct Number': '2', ' Part Number': '1', 'Primer Sequence': 'TACGACTCACTATAGGGAGAtactagagttaaggaggtaaaaaaaatgggtccggtcgtt'}
{' Direction': 're primer', ' Construct Number': '2', ' Part Number': '2', 'Primer Sequence': 'ttacctccttaactctagtaTCTCCCTATAGTGAGTCGTATTACTCTAGAAGCGGCCGCg'}
{' Direction': 'fw primer', ' Construct Number': '3', ' Part Number': '2', 'Primer Sequence': 'gtaaatccaagttgtaataatactagagTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTC'}
{' Direction': 're primer', ' Construct Number': '3', ' Part Number': '1', 'Primer Sequence': 'GGGGTTATGCTActctagtattattacaacttggatttaccacctttcttcgccttgatc'}
{' Direction': 'fw primer', ' Construct Number': '3', ' Part Number': '1', 'Primer Sequence': 'TAACTATCACTATAGGGAGAtactagagttaaggaggtaaaaaaaatgggtccggtcgtt'}
{' Direction': 're primer', ' Construct Number': '3', ' Part Number': '2', 'Primer Sequence': 'ttacctccttaactctagtaTCTCCCTATAGTGATAGTTATTACTCTAGAAGCGGCCGCg'}
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其他方式:
import operator
primers_unsorted.sort(key=operator.itemgetter(' Construct Number', ' Part Number'))
for row in primers_unsorted:
print(row)
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