是什么导致大 INSERT 变慢和磁盘使用量激增?

jer*_*ran 6 postgresql performance insert postgresql-9.3 write-ahead-logging postgresql-performance

我有一个大约 310 万行的表,其定义和索引如下:

CREATE TABLE digiroad_liikenne_elementti (
    ogc_fid serial NOT NULL,
    wkb_geometry geometry(Geometry,4258),
    tiee_tila numeric(9,0),
    vaylatyypp numeric(9,0),
    toiminnall numeric(9,0),
    eurooppati character varying(254),
    kansalline numeric(9,0),
    tyyppi numeric(9,0),
    liikennevi numeric(9,0),
    ens_talo_o numeric(9,0),
    talonumero numeric(9,0),
    ens_talo_v numeric(9,0),
    oik_puol_t character varying(254),
    tieosan_ta numeric(9,0),
    viim_talo_ numeric(9,0),
    viim_tal_1 numeric(9,0),
    vas_puol_t character varying(254),
    laut_tyypp numeric(9,0),
    lautta_lii numeric(9,0),
    inv_paalu_ numeric(19,11),
    inv_paal_1 numeric(19,11),
    liitalue_o numeric(9,0),
    ketju_oid numeric(9,0),
    tietojoukk numeric(9,0),
    ajoratanum numeric(4,0),
    viite_guid character varying(254),
    "timestamp" date,
    tiee_kunta numeric(9,0),
    toissij_ti character varying(254),
    viite_oid numeric(9,0),
    k_elem_id numeric(9,0),
    region character varying(40) DEFAULT 'REGION'::character varying,
    CONSTRAINT digiroad_liikenne_elementti_pkey PRIMARY KEY (ogc_fid)
);

CREATE INDEX digiroad_liikenne_elementti_wkb_geometry_geom_idx
  ON digiroad_liikenne_elementti USING gist (wkb_geometry);

CREATE INDEX dle_k_elem_id_idx
  ON digiroad_liikenne_elementti USING btree (k_elem_id);

CREATE INDEX dle_ogc_fid_idx
  ON digiroad_liikenne_elementti USING btree (ogc_fid);

CREATE INDEX dle_region_idx
  ON digiroad_liikenne_elementti USING btree (region COLLATE pg_catalog."default");
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另一个有 860 万行的表包含第一个表的行的属性,这些表可以用k_elem_idAND 连接region

CREATE TABLE digiroad_segmentti (
    ogc_fid serial NOT NULL,
    wkb_geometry geometry(Geometry,4258),
    segm_tila numeric(9,0),
    tyyppi numeric(9,0),
    loppupiste numeric(19,11),
    alkupiste numeric(19,11),
    vaikutuska numeric(9,0),
    vaikutussu numeric(9,0),
    vaikutusai character varying(254),
    tieosanume numeric(19,11),
    tienumero numeric(9,0),
    dyn_arvo numeric(9,0),
    dyn_tyyppi numeric(9,0),
    omistaja_t numeric(9,0),
    pysakki_va numeric(9,0),
    pysakki_ty numeric(9,0),
    pysakki_su numeric(9,0),
    pysakki_ka numeric(9,0),
    pysakki_yl character varying(254),
    palvelu_pa numeric(9,0),
    toissijain numeric(9,0),
    siltataitu numeric(9,0),
    rdtc_tyypp numeric(9,0),
    rdtc_alaty numeric(9,0),
    rdtc_paikk numeric(19,11),
    rdtc_luokk numeric(9,0),
    rdtc_liitt character varying(254),
    palvelu_ob numeric(9,0),
    ketju_oid numeric(9,0),
    tietojoukk numeric(9,0),
    ajoratanum numeric(4,0),
    viite_guid character varying(254),
    "timestamp" date,
    sivusiirty numeric(19,11),
    toissij_ti character varying(254),
    viite_oid numeric(9,0),
    k_elem_id numeric(9,0),
    region character varying(40) DEFAULT 'REGION'::character varying,
    CONSTRAINT digiroad_segmentti_pkey PRIMARY KEY (ogc_fid)
);

CREATE INDEX digiroad_segmentti_wkb_geometry_geom_idx
  ON digiroad_segmentti USING gist (wkb_geometry);

CREATE INDEX ds_dyn_arvo_idx
  ON digiroad_segmentti USING btree (dyn_arvo);

CREATE INDEX ds_dyn_tyyppi_idx
  ON digiroad_segmentti USING btree (dyn_tyyppi);

CREATE INDEX ds_k_elem_id_idx
  ON digiroad_segmentti USING btree (k_elem_id);

CREATE INDEX ds_ogc_fid_idx
  ON digiroad_segmentti USING btree (ogc_fid);

CREATE INDEX ds_region_idx
  ON digiroad_segmentti USING btree (region COLLATE pg_catalog."default");

CREATE INDEX ds_tyyppi_idx
  ON digiroad_segmentti USING btree (tyyppi);
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我正在尝试将第一个表的行(经过一些修改)插入到新表中:

CREATE TABLE edge_table (
    id serial NOT NULL,
    geom geometry,
    source integer,
    target integer,
    km double precision,
    kmh double precision DEFAULT 60,
    kmh_winter double precision DEFAULT 50,
    cost double precision,
    cost_winter double precision,
    reverse_cost double precision,
    reverse_cost_winter double precision,
    x1 double precision,
    y1 double precision,
    x2 double precision,
    y2 double precision,
    k_elem_id integer,
    region character varying(40),
    CONSTRAINT edge_table_pkey PRIMARY KEY (id)
);
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由于运行单个插入语句需要很长时间,而且我无法查看该语句是否被卡住或其他原因,因此我决定在函数的循环内以较小的块执行它。

该函数如下所示:

DROP FUNCTION IF EXISTS insert_function();
CREATE OR REPLACE FUNCTION insert_function()
    RETURNS VOID AS
    $$
DECLARE
    const_type_1 CONSTANT int := 5;
    const_type_2 CONSTANT int := 11;
    i int := 0;
    row_count int;
BEGIN

    CREATE TABLE IF NOT EXISTS edge_table (
        id serial PRIMARY KEY,
        geom geometry,
        source integer,
        target integer,
        km double precision,
        kmh double precision DEFAULT 60,
        kmh_winter double precision DEFAULT 50,
        cost double precision,
        cost_winter double precision,
        reverse_cost double precision,
        reverse_cost_winter double precision,
        x1 double precision,
        y1 double precision,
        x2 double precision,
        y2 double precision,
        k_elem_id integer,
        region varchar(40)
    );


    batch_size := 1000;
    SELECT COUNT(*) FROM digiroad_liikenne_elementti INTO row_count;

    WHILE i*batch_size < row_count LOOP

        RAISE NOTICE 'insert: % / %', i * batch_size, row_count;

        INSERT INTO edge_table (kmh, kmh_winter, k_elem_id, region)
        SELECT      CASE WHEN DS.dyn_arvo IS NULL THEN 60 ELSE DS.dyn_arvo END,
                    CASE WHEN DS.dyn_Arvo IS NULL THEN 50 ELSE DS.dyn_arvo END,
                    DR.k_elem_id,
                    DR.region
        FROM        (
                        SELECT  DLE.k_elem_id,
                                DLE.region,
                        FROM    digiroad_liikenne_elementti DLE
                        WHERE   DLE.ogc_fid >= i * batch_size
                                AND
                                DLE.ogc_fid <= i * batch_size + batch_size
                    ) AS DR
                    LEFT JOIN
                    digiroad_segmentti DS ON
                        DS.k_elem_id = DR.k_elem_id
                        AND
                        DS.region = DR.region
                        AND
                        DS.tyyppi = const_type_1
                        AND
                        DS.dyn_tyyppi = const_type_2;

        i := i + 1;
    END LOOP;
END;
$$
LANGUAGE 'plpgsql' VOLATILE STRICT;
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问题是它开始非常快地通过循环,但在某些时候会减慢到爬行。当它变慢时,同时我的 Windows 8 任务管理器中的磁盘使用率上升到 99%,所以我怀疑这与问题有关。

INSERT使用一些随机值自行运行语句i执行速度非常快,因此问题似乎仅在函数内的循环中运行时才会出现。这是EXPLAIN (ANALYZE,BUFFERS)来自一个这样的单一执行:

Insert on edge_table  (cost=0.86..361121.68 rows=1031 width=23) (actual time=3405.101..3405.101 rows=0 loops=1)
  Buffers: shared hit=36251 read=3660 dirtied=14
  ->  Nested Loop Left Join  (cost=0.86..361121.68 rows=1031 width=23) (actual time=61.901..3377.609 rows=986 loops=1)
        Buffers: shared hit=32279 read=3646
        ->  Index Scan using dle_ogc_fid_idx on digiroad_liikenne_elementti dle  (cost=0.43..85.12 rows=1031 width=19) (actual time=31.918..57.309 rows=986 loops=1)
              Index Cond: ((ogc_fid >= 200000) AND (ogc_fid < 201000))
              Buffers: shared hit=27 read=58
        ->  Index Scan using ds_k_elem_id_idx on digiroad_segmentti ds  (cost=0.44..350.16 rows=1 width=23) (actual time=2.861..3.337 rows=0 loops=986)
              Index Cond: (k_elem_id = dle.k_elem_id)
              Filter: ((tyyppi = 5::numeric) AND (dyn_tyyppi = 11::numeric) AND (vaikutussu = 3::numeric) AND ((region)::text = (dle.region)::text))
              Rows Removed by Filter: 73
              Buffers: shared hit=31266 read=3588
Total runtime: 3405.270 ms
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我的系统在具有 8Gb RAM 的 Windows 8 上运行 PostgreSQL 9.3.5。

我尝试了不同的批量大小,以不同的方式进行查询并在 Postgres 配置中增加内存变量,但似乎没有什么能真正解决这个问题。

已从其默认值更改的配置变量:

shared_buffers = 2048MB
work_mem = 64MB
effective_cache_size = 6000MB
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我想找出导致这种情况发生的原因以及可以采取的措施。

Erw*_*ter 7

当创建一个新表避免写的成本预写日志(WAL) 完全CREATE TABLE AS
请参阅@Kassandry 的回答以了解 WAL 如何解决这个问题。

CREATE OR REPLACE FUNCTION insert_function()
  RETURNS void AS
$func$
DECLARE
   const_type_1 CONSTANT int := 5;
   const_type_2 CONSTANT int := 11;
BEGIN    
   CREATE SEQUENCE edge_table_id_seq;

   CREATE TABLE edge_table AS
   SELECT nextval('edge_table_id_seq'::regclass)::int AS id
        , NULL::geometry         AS geom
        , NULL::integer          AS source
        , target::integer        AS target
        , NULL::float8           AS km
        , COALESCE(DS.dyn_arvo::float8, float8 '60') AS kmh
        , COALESCE(DS.dyn_Arvo::float8, float8 '50') AS kmh_winter
        , NULL::float8           AS cost
        , NULL::float8           AS cost_winter
        , NULL::float8           AS reverse_cost
        , NULL::float8           AS reverse_cost_winter
        , NULL::float8           AS x1
        , NULL::float8           AS y1
        , NULL::float8           AS x2
        , NULL::float8           AS y2
        , D.k_elem_id::integer   AS k_elem_id
        , D.region::varchar(40)  AS region
   FROM   digiroad_liikenne_elementti D
   LEFT   JOIN digiroad_segmentti DS
             ON DS.k_elem_id = D.k_elem_id
            AND DS.region = D.region
            AND DS.tyyppi = const_type_1
            AND DS.dyn_tyyppi = const_type_2;

   ALTER TABLE edge_table
      ADD CONSTRAINT edge_table_pkey PRIMARY KEY(id)
    , ALTER COLUMN id SET NOT NULL
    , ALTER COLUMN id SET DEFAULT nextval('edge_table_id_seq'::regclass)
    , ALTER COLUMN kmh SET DEFAULT 60
    , ALTER COLUMN kmh_winter SET DEFAULT 50;

   ALTER SEQUENCE edge_table_id_seq OWNED BY edge_table.id;    
END
$func$ LANGUAGE plpgsql;
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文档:

除了避免存档器或 WAL 发送器处理 WAL 数据的时间之外,这样做实际上会使某些命令更快,因为它们被设计为根本不写入 WAL 如果wal_levelminimal。(他们可以通过fsync在最后执行 an比编写 WAL更便宜地保证碰撞安全 。)这适用于以下命令:

  • CREATE TABLE AS SELECT

  • CREATE INDEX(以及变体,例如ALTER TABLE ADD PRIMARY KEY

  • ALTER TABLE SET TABLESPACE

  • CLUSTER

  • COPY FROM, 当目标表已在同一事务中较早创建或截断时

同样重要

  • CREATE TABLE AS使得无法直接使用伪类型serial。但由于这只是一个“makro”,您可以手动完成所有操作:创建序列,使用它来生成id值。最后,设置列默认值并使列拥有序列。有关的:

  • plpgsql 函数包装器是可选的(便于重复使用),您可以在事务中运行普通 SQLBEGIN; ... COMMIT;

  • 插入数据之后添加也更快,因为在一块中创建(基础)索引比增量添加值更快。PRIMARY KEY

  • 您的分区存在逻辑错误

    WHERE DLE.ogc_fid >= i * batch_size
    AND   DLE.ogc_fid <= i * batch_size + batch_size
    
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    最后一行将与下一个分区重叠,该行将被重复插入,导致 PK 中的唯一违规。使用<而不是<=可以解决这个问题 - 但我完全删除了分区。

  • 如果你运行这个反复,一个多列索引digiroad_segmentti (k_elem_id, tyyppi, dyn_tyyppi, region)可能需要支付,这取决于数据的分布。

小事

  • 不要引用语言plpgsql名称,它是一个标识符。
  • 将没有参数的函数标记为 是毫无意义的STRICT
  • VOLATILE 是默认值,只是噪音。
  • 使用COALESCE提供NULL值的默认值。

  • 您的某些double precision( float8) 列可能会更好, integer因为您大部分时间都numeric (9,0)在旧表中,可以用更便宜的普通integer.

  • 该列region varchar(40)看起来像是规范化的候选者(除非区域大多是唯一的?)创建一个区域表并仅用region_id作主表中的 FK 列。


Kas*_*dry 5

如果您只更改了shared_bufferswork_memeffective_cache_sizeconfig 变量,那么您可能仍在使用checkpoint_segments=3.

在这种情况下,您只有三个 WAL 段,因此需要不断地回收它们,每次都强制写入数据文件,这会导致大量 I/O 活动,并且肯定会减慢您的机器的速度。您可以通过查看日志并搜索短语来检查检查点行为checkpoints are occurring too frequently。您还可以通过log_checkpoints=on在 postgresql.conf 中启用来查看他们在做什么

我建议将您更改checkpoint_segments为更大的值,例如 40,然后checkpoint_completion_target更改为 0.9,以尝试消除您所描述的行为。

这些设置在 9.3 的 PostgreSQL 文档的预写日志部分中进一步描述。=)