安装 R 包时权限被拒绝

Question

我在 Windows 子系统 WSL 上运行的 ubuntu 18.04 上安装了 R（版本 3.6.0）。

现在我在安装某些特定软件包时遇到问题。例如xml2。当我运行命令时install.packages("xml2")，出现以下错误：

mv: cannot move '/usr/local/lib/R/site-library/00LOCK-xml2/00new/xml2' to '/usr/local/lib/R/site-library/xml2': Permission denied
ERROR:   moving to final location failed

我想可能有某种方法可以让自己完全允许自己管理自己的东西，有人知道如何解决这个问题吗？

Answer 1

stackoverflow.com 上建议的这个解决方案对我有用。

避免这种情况的最好方法是在命令行上使用“--no-lock”参数，例如，

R CMD INSTALL --no-lock <pkg>

在 NFS 文件系统上，有时需要关闭哪些内容并不明显。在 R 中，您可以使用以下命令在命令中执行此操作：

install.packages("Rcpp", dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock'))

Answer 2

卸载 R 版本 3.6.0，并删除 R PPA（如果您的软件源中存在 R PPA），方法是在/etc/apt/sources.list包含此 PPA 的行前面添加一个字符#，将其变成注释。然后运行sudo apt update以刷新可用软件列表。现在您已经删除了不起作用的 R 软件包，您可以从默认的 Ubuntu 18.04 存储库安装 r-base 和 r-cran-xml2 了。

要在 Ubuntu 18.04 中安装 xml2 R 软件包，请打开终端并输入：

sudo apt install r-base r-cran-xml2  

该 GNU R XML 解析器包使用简单、一致的接口来处理 XML 文件。它构建在“libxml2”C 库之上。