计算“X”之间的行数

Question

我想计算“X”之间的线数。这只是一个例子；我必须将代码应用于复杂的生物学结果。如果您能建议一些命令，最好使用awk，grep或者sed我熟悉这些命令，我将不胜感激。

例子：

X
Y
Y
Y
X
Y
Y
Y
Y
X
Y
X

期望输出：

3
4
1

Answer 1

与awk：

$ awk '!/X/{count++}/X/{print count; count = 0}' input

3
4
1

为不包含的每一行增加一个计数X；打印并重置包含X.

Answer 2

$ awk '/X/ && prev{print NR-prev-1} /X/{prev=NR}' file
3
4
1

这个怎么运作：

awk 隐式地逐行读取输入文件。

• /X/ && prev{print NR-prev-1}

  对于包含X并且如果我们之前已经为 赋值的任何行prev，则打印出当前行的编号NR，减去prev减一。

• /X/{prev=NR}

  对于包含 的任何行，X将变量prev设置为当前行号NR。

Answer 3

另一种awk适用于 OP 样本数据的简单方法，如果X不在第一个甚至最后一个或重复的 X 中。

awk -v RS='X' 'NF{print NF}' infile

当每一行中只有一个字段且默认 FS 有任何空格时，上面是正确的，否则下面在一般情况下被修改为按行计数。您可以在那里输入您的PATTERN代替X。

awk -F'\n' -v RS='X' 'NF>2{print NF-2}'

样本输入：

X
Y YYY Y
YY
YY Y YY YY Y Y
X
Y Y Y
X
Y
Y
X
X

输出是：

3
1
2