R和RStudio安装和包错误

Question

使用以下代码在 Ubuntu 16.04 中安装 R 和 RStudio 后：

sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base
sudo apt-get install r-base-dev

和

sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download1.rstudio.org/rstudio-1.0.143-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-1.0.143-amd64.deb

我正在尝试安装软件包，但在 R 控制台中出现错误，例如

install.packages("fGarch")
将软件包安装到“/usr/local/lib/R/site-library”
（因为 'lib' 未指定）
install.packages 中的警告：
  'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' 不可写

由于我是 Linux 新手，我不知道在哪个目录中安装 R 包。我不确定这是问题所在，还是我在安装过程中犯了任何错误。谁能帮我解决这个问题？提前致谢。

Answer 1

如果您想为所有用户安装 R 附加包，您/usr/local/lib需要授予 R 超级用户权限才能在那里创建文件。要以超级用户身份安装 R 附加包，请运行：

\n\n

sudo R CMD INSTALL <PACKAGES\xe2\x80\xa6>\n

\n\n

您可以将其中替换<PACKAGES\xe2\x80\xa6>为要安装的任意数量的附加软件包的名称。

\n\n\n\n

如果您只想为自己安装软件包，则不需要授予 R 超级用户权限，但需要指定安装目标。一种方便的方法是使用环境变量：

\n\n

export R_LIBS_USER=<PATH>\n

\n\n

您可以将其中替换<PATH>为用户特定的 R 包的目录路径。我建议~/.local/lib/R/site-library。现在您可以安装软件包：

\n\n

R CMD INSTALL <PACKAGES\xe2\x80\xa6>\n

\n\n

您需要确保在启动 R 之前设置此环境变量，否则它将找不到安装到该位置的软件包。最好的选择是将上述export命令附加到文件中~/.profile。有关更多信息，请参阅环境变量。

\n

Answer 2

尝试在sudo下通过终端打开 R。这将要求您输入密码，并允许您授予覆盖系统中文件的权限。图片

编辑：为了清晰起见，请参阅图片