小编Deb*_*raj的帖子

我有几个大的 .csv 文件，我想将它们转换为二进制（1 和 0）格式。其中，除前两个字段外，所有包含文本的单元格都将变为 1，0 将保持为 0。

head Test.csv
Iss1,1,0,0,Hsapiens-I34,0,0,0,Mmusculus-H01,0,0
Iss1,11,0,Scerevisiae-U09,Hsapiens-I05,0,0,0,0,0,0
Iss1,21,0,0,Hsapiens-I05,0,0,0,Hsapiens-I31,0,0
Iss1,31,0,0,Mmusculus-H13,0,0,0,0,0,Hsapiens-I31
Iss1,41,0,Scerevisiae-U09,0,0,0,0,0,0,Hsapiens-I21
Iss1,51,0,0,0,0,0,0,Scerevisiae-U25,0,Hsapiens-I21
Iss1,61,0,0,Hsapiens-I34,0,0,0,Mmusculus-H13,0,0

预期结果是

head Test.csv
Iss1,1,0,0,1,0,0,0,1,0,0
Iss1,11,0,1,1,0,0,0,0,0,0
Iss1,21,0,0,1,0,0,0,1,0,0
Iss1,31,0,0,1,0,0,0,0,0,1
Iss1,41,0,1,0,0,0,0,0,0,1
Iss1,51,0,0,0,0,0,0,1,0,1
Iss1,61,0,0,1,0,0,0,1,0,0

其中文件中的所有文本都转换为 1。

如果有人能给我一些关于如何克服这个问题的建议，我将不胜感激。

谢谢

我想使用文件中的名称一次创建多个文件，list.txt我该怎么做？

样品list.txt：

EOG090W002U
EOG090W00C1
EOG090W00DC
EOG090W00DE
EOG090W00E5
EOG090W00HR
EOG090W00MH
EOG090W00MS
EOG090W00PB
EOG090W00U4
EOG090W00UK
EOG090W00WM
EOG090W00WR

假设我有这个list.txt包含一些 ID 号。现在我想使用这些 id 作为名称来制作单独的文件（例如EOG090W002U_M0.ctl, EOG090W00C1_M0.ctl, EOG090W00DC_M0.ctl）。此外，文件的内容需要相应地更改。例如EOG090W002U_M0.ctl，EOG090W00C1_M0.ctl文件的内容将是

seqfile = EOG090W002U_p.phy
treefile = Constant.txt
outfile = EOG090W002U_M0_mlc

或者

seqfile = EOG090W00C1_p.phy
treefile = Constant.txt
outfile = EOG090W00C1_M0_mlc

其中*.phy和Constant.txt将在同一文件夹中提供。

当第 2 列、第 3 列和第 1 列中的连续单元格相同时，我尝试计算第 9 列中C_R和的数量。S_R该文件采用床格式（制表符分隔格式）。原始文件很大，第一列定义了染色体编号。文件的前几行看起来像这样，

chr1    10200   10300   8   10000   10214   100 214 S_R
chr1    10200   10300   8   10009   10233   100 224 S_R
chr1    10200   10300   8   10014   10220   100 206 S_R
chr1    10200   10300   8   10045   10215   100 170 S_R
chr1    10200   10300   8   10068   10209   100 141 S_R
chr1    10200   10300   8   10074   10300   100 226 C_R
chr1    10200   10300   8   10182   10283   100 101 S_R
chr1    10200   10300   8 …