我正在尝试使用基因组坐标构建一个 .bed 文件,并且我非常接近。只是错过了最后一步。我有一个看起来像这样的文件:
LQNS02278165.1 13104710 13109495 BEL-1_PH-I 4785
LQNS02278165.1 9139127 9142308 BEL-1_PH-I 3181
LQNS02278165.1 9222957 9221339 BEL-1_PH-I -1618
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我需要用符号替换第 5 列,其中将是基因组中的方向。理想情况下,输出如下所示:
LQNS02278165.1 13104710 13109495 BEL-1_PH-I +
LQNS02278165.1 9139127 9142308 BEL-1_PH-I +
LQNS02278165.1 9222957 9221339 BEL-1_PH-I -
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任何关于 awk 的建议将不胜感激!谢谢
awk ×1