小编jub*_*us1的帖子

举个例子，假设我有：

One, Two.
OnE, Two.
ONE, TWO.

我只想将全部大写的行替换为小写，这样我就得到：

One, Two.
OnE, Two.
one, two.

我在尝试：

gsed '/[a-z]/!c\L&'

它正确匹配行，但将其替换为：L&

One, Two.
OnE, Two.
L&

如何将其转换为小写？

我在 L 之前尝试了 2 或 3 个反斜杠，但它只是将它们放入输出中。

如果有更好的选择，我将使用 awk 或 tr 或其他一些实用程序。

另外，如果版本很重要：

gsed --version
gsed (GNU sed) 4.9

我正在处理一个格式如下的文件：

12345:ABCDEFG

789:HIJK

4963158:LMNOPQRSTUV

每行以不同长度的数字开头，后跟一个冒号，然后是一串不同长度的字母。我想只捕获每行开头的数字并将它们放入一个新文件中，如下所示。

12345

789

4963158

这与我得到的最接近，但它仍然打印整行，而不仅仅是数字。

sed -r 's/([^0-9]+d)(:)([A-Z]+)$/\1/' example.txt >> justnumbers.txt

我在语法上做错了什么？

我有一个看起来像这样的文件

$ cat IP
10.3.1.1
10.4.1.1
10.6.3.1
10.19.4.2
10.22.3.4

我如何让它看起来像：

$ cat IP 
10.3.1.1, 10.4.1.1, 10.6.3.1, 10.19.4.2, 10.22.3.4

我有几个大的 .csv 文件，我想将它们转换为二进制（1 和 0）格式。其中，除前两个字段外，所有包含文本的单元格都将变为 1，0 将保持为 0。

head Test.csv
Iss1,1,0,0,Hsapiens-I34,0,0,0,Mmusculus-H01,0,0
Iss1,11,0,Scerevisiae-U09,Hsapiens-I05,0,0,0,0,0,0
Iss1,21,0,0,Hsapiens-I05,0,0,0,Hsapiens-I31,0,0
Iss1,31,0,0,Mmusculus-H13,0,0,0,0,0,Hsapiens-I31
Iss1,41,0,Scerevisiae-U09,0,0,0,0,0,0,Hsapiens-I21
Iss1,51,0,0,0,0,0,0,Scerevisiae-U25,0,Hsapiens-I21
Iss1,61,0,0,Hsapiens-I34,0,0,0,Mmusculus-H13,0,0

预期结果是

head Test.csv
Iss1,1,0,0,1,0,0,0,1,0,0
Iss1,11,0,1,1,0,0,0,0,0,0
Iss1,21,0,0,1,0,0,0,1,0,0
Iss1,31,0,0,1,0,0,0,0,0,1
Iss1,41,0,1,0,0,0,0,0,0,1
Iss1,51,0,0,0,0,0,0,1,0,1
Iss1,61,0,0,1,0,0,0,1,0,0

其中文件中的所有文本都转换为 1。

如果有人能给我一些关于如何克服这个问题的建议，我将不胜感激。

谢谢

如何在以数字开头的每列的开头添加一个字符：

添加 ac的示例：
4 r4 8 8 4

所以我得到这个输出：
c4 r4 c8 c8 c4

它应该适用于可变数量的列。

任何人都知道如何扭转这个：

FX_AM140_EML AM140
Backend/aa.java
Backend/bb.java
Backend/cc.java
Backend/dd.java
Backend/ee.java

FX_AM172_EML AM172
Backend/aa.java
Backend/bb.java

到这个？

FX_AM140_EML AM140 Backend/aa.java
FX_AM140_EML AM140 Backend/bb.java
FX_AM140_EML AM140 Backend/cc.java
FX_AM140_EML AM140 Backend/dd.java
FX_AM140_EML AM140 Backend/ee.java
FX_AM172_EML AM172 Backend/aa.java
FX_AM172_EML AM172 Backend/bb.java

我有一个文件，其中的条目key: value格式如下：

猫数据.txt

name: 'tom'
tom_age: '31'
status_tom_mar: 'yes'
school: 'anne'
fd_year_anne: '1987'
name: 'hmz'
hmz_age: '21'
status_hmz_mar: 'no'
school: 'svp'
fd_year_svp: '1982'
name: 'toli'
toli_age: '41'

同样...

我只需要查找并打印那些key: value具有重复键作为单个条目的键。

下面的代码让我得到重复的键

cat data.txt | awk '{ print $1 }' | sort  | uniq -d
name:
school:

但是，我想要输出将重复键的值连接在一行中。

预期输出：

name: ['tom', 'hmz', 'toli']
school: ['anne', 'svp']
tom_age: '31'
status_tom_mar: 'yes'
fd_year_anne: '1987'
hmz_age: '21'
status_hmz_mar: 'no'
fd_year_svp: '1982'
toli_age: '41'

你能建议一下吗？

我在 Ubuntu 机器上有这个数据集：

37.500  0.0000  0.005605
37.750  0.0000  -0.027858
38.000  0.0000  -0.060678
38.250  0.0000  -0.088557
38.500  0.0000  -0.109210
38.750  0.0000  -0.122482
39.000  0.0000  -0.129770
39.250  0.0000  -0.133190
39.500  0.0000  -0.134538
39.750  0.0000  -0.134015
40.000  0.0000  -0.129660
40.250  0.0000  -0.117858
40.500  0.0000  -0.094709
40.750  0.0000  -0.057622
41.000  0.0000  -0.006853

我需要找到第 3 列的最大值，该最大值位于第 1 列的 38 和 40 之间。

这只是一个示例数据集。

我正在学习Perl，但我不知道如何解决这个问题。

我有一个.txt以下形式的文件：

1 16.3346384
2 11.43483
3 1.19819
4 1.1113829
5 1.0953443
6 1.9458343
7 1.345645
8 1.3847385794
9 1.3534344
10 2.1117454
11 1.17465
12 1.4587485

第一列仅包含行号，此处不感兴趣，但它存在于文件中；第二列中的值是相关部分。

我想输出第二列中编号小于 2.00 的最长连续行序列。对于上面的示例，这将是第 3 行到第 9 行，输出应为：

1.19819
1.1113829
1.0953443
1.9458343
1.345645
1.3847385794
1.3534344

我有大约 25,000 个 JSON 文件需要验证和检查，我注意到一些文件已经重复，导致使用 Excel 将 JSON 转换为 CSV 时出现错误。

我试图删除之后的所有字符串，"version":"0.2.3"}因为这表明 JSON 的结尾，然后再重复，"version": "0.2.3"}{"analysis": {因此我需要保留并"version": "0.2.3"}删除{"analysis": {其后面的所有内容，并将这些更改应用到所有 25,000 个文件。我见过有人使用 grep 和 sed 但我自己似乎无法让它们工作。

如果有人可以提供帮助，我将不胜感激，因为手动删除文本是不可取的，所以我希望在 bash 或其他东西中有一个衬垫！

下面是我需要修复的内容（其中一个文件的精简版本），下面是所需的输出。正如您所看到的，无论出于何种原因，JSON 数据可能会在 API 使用过程中自我复制。

有问题的输入（已修剪json）：

{"analysis":{"score":3},"sample":{"completed":"2022-01-27T21:22:21Z","created":"2022-01-27T21:17:57Z","id":"220127-z5h84saffl","md5":"7871a75734af389b787bad57a3ea087d","score":3,"sha1":"58a8689ee76a46559ea56a52d20425f44c8ff601","sha256":"23c5dee027c7969aabb5828641c55a005f30fb166a5006dbe3a817f56ca0e32a"},"version":"0.2.3"}{"analysis":{"score":3},"sample":{"completed":"2022-01-27T21:22:21Z","created":"2022-01-27T21:17:57Z","id":"220127-z5h84saffl","md5":"7871a75734af389b787bad57a3ea087d","score":3,"sha1":"58a8689ee76a46559ea56a52d20425f44c8ff601","sha256":"23c5dee027c7969aabb5828641c55a005f30fb166a5006dbe3a817f56ca0e32a"},"version":"0.2.3"}

期望的输出：

{"analysis":{"score":3},"sample":{"completed":"2022-01-27T21:22:21Z","created":"2022-01-27T21:17:57Z","id":"220127-z5h84saffl","md5":"7871a75734af389b787bad57a3ea087d","score":3,"sha1":"58a8689ee76a46559ea56a52d20425f44c8ff601","sha256":"23c5dee027c7969aabb5828641c55a005f30fb166a5006dbe3a817f56ca0e32a"},"version":"0.2.3"}

我在 Linux 机器上有一个包含两列的文本文件：

• 第1列 = id_no（大部分为5位，有的为6位）；
• 第 2 列 = Genetic_markers（全部长度为 50674 位）；

12345 0102010205
54322 2221110051
123456 1122011510

我想将文件更改为如下所示：

 12345 0 1 0 2 0 1 0 2 0 5
 54322 2 2 2 1 1 1 0 0 5 1
123456 1 1 2 2 0 1 1 5 1 0

1. 如何更改第一列，使其向右对齐（如数字所示）？

2. 有人可以帮我用最可靠的方法来更改第二列数字之间的空格吗？请解释代码的元素及其作用。

谢谢

我有一个由目录中所有文件生成的文本文件。我想使用此文件作为我拥有的脚本的输入，但我需要以特定方式格式化文本文件才能正确解析。

目前，文本文件（文件名列表）的格式如下：

A1_R1.fastq.gz
A1_R2.fastq.gz
A2_R1.fastq.gz
A2_R2.fastq.gz
A3_R1.fastq.gz
A3_R2.fastq.gz

我需要每个样本的配对读取（具有相同名称但不同RN值的文件）位于同一行，并用制表符分隔：

A1_R1.fastq.gz A1_R2.fastq.gz
A2_R1.fastq.gz A2_R2.fastq.gz
A3_R1.fastq.gz A3_R2.fastq.gz

由于我有 >1000 个条目，我希望有一种使用 awk 或类似方法来修改文件的方法，但我对 awk 没有太多经验。

我有一些.vcf文件，我想过滤掉一些变体。这只是我文件的一小部分：文件开头有一些标题行（以 ## 开头），然后是变体（每个变体一行）。

##fileformat=VCFv4.2
##source=combiSV-v2.2
##fileDate=Mon May  8 11:32:53 2023
##contig=<ID=chrM,length=16571>
##contig=<ID=chr1,length=249250621>    
##INFO=<ID=END,Number=1,Type=Integer,Description="End position of the variant described in this record">
##INFO=<ID=SVCALLERS,Number=.,Type=String,Description="SV callers that support this SV">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=DR,Number=1,Type=Integer,Description="# High-quality reference reads">
##FORMAT=<ID=DV,Number=1,Type=Integer,Description="# High-quality variant reads">
#CHROM  POS ID  REF ALT QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  Sample
1   10862   id.1    N   <INS>   .   PASS    SVTYPE=INS;SVLEN=101;END=10862;SVCALLERS=cutesv,SVIM    GT:DR:DV    1/1:0:26
1   90258   id.2    N   <INS>   .   PASS    SVTYPE=INS;SVLEN=118;END=90258;SVCALLERS=SVIM,NanoSV    GT:DR:DV    1/1:0:9
1   90259   id.3    N   <INS>   .   PASS    SVTYPE=INS;SVLEN=36;END=90259;SVCALLERS=Sniffles    GT:DR:DV    0/1:44:7
1   185824 …