如何从 Unix 中的文件中删除前两列具有相同值的行？

Question

我有一个包含几列的文件。我想从此文件中删除第一列和第二列显示相同值的整行。

例如，我的文件如下：

Variant         rsid         chr     pos
1:10177_A_AC    rs367896724     1    10177
1:10352_T_TA    rs201106462     1    10352
1:10511_G_A     rs534229142     1    10511
1:10616_CCGCCGTTGCAAAGGCGCGCCG_C        1:10616_CCGCCGTTGCAAAGGCGCGCCG_C        1       10616

我想删除Variant列的值等于rsid列的行，所以我想获得一个最终文件，如下所示：

Variant         rsid         chr     pos
1:10177_A_AC    rs367896724     1    10177
1:10352_T_TA    rs201106462     1    10352
1:10511_G_A     rs534229142     1    10511

我尝试运行以下命令：

awk '$1==$2{sed -i} input.file > output.file

awk -F, '$1==$2' input.file > output.file

但他们都没有工作。

我如何通过使用awk和/或来解决它sed？

Answer 1

你几乎成功了

awk '$1!=$2' input.file > output.file

这将保持第一个和第二个字段不同的行（因此在相等时删除）。

• -F,是错误的，因为,不是您的字段分隔符，并且以这种方式设置会使 awk 误解行内容
• '$1==$2{sed -i} 既不是 awk 也不是 sed 函数

Answer 2

您已经有了最好的通用答案，但在您的特定情况下，您也可以简单地选择第二个字段以 开头的所有行rs：

$ awk '$2 ~ /^rs/' file
Variant         rsid         chr     pos
1:10177_A_AC    rs367896724     1    10177
1:10352_T_TA    rs201106462     1    10352
1:10511_G_A     rs534229142     1    10511