grep 循环：我使用一个文件的每一行作为查询来查找与另一个文件匹配的内容。为什么我的输出不一致？

Question

我有一个query_ids包含多行的文件，例如：

id1
id2
id3

我用来grep idx在 中查找 id 的匹配项my_file。
我将这些匹配重定向到一个新matches文件。
我还使用grepwith 选项-v来获取重定向到mismatches文件的所有不匹配项。我正在使用这个小脚本：

#!/bin/bash


for i in $(cat query_ids)
do 
    # saving matches 
    grep "$i" my_file >> matches
    # saving mismatches
    grep -v "$i" my_file >> missing
done

我显然做错了什么：当从文件中
手动搜索一些 id 时，我发现它们存在。 即使该文件应该只包含未在 I 中找到的文件中的 id，但我确实找到了匹配项。missingmy_file
missingquery_idsmy_file

因此，当选择一些随机 id 时，让我们说 id3 通过执行grep id3 missing并且grep id3 my_file都返回匹配项。<br>

为什么我的代码将 id3 分配给mismatches文件？

1. 我尝试删除周围的引号$i，但它并没有改变结果。
2. 我还尝试echo "$i"确保 id 确实是循环的。

我缺少什么？

Answer 1

您所做的就是获取一个 ID，例如id1，然后将与该 ID 匹配的所有行提取到 中matches。然后将所有不匹配的行提取到missing.

对于下一个 ID，，id2然后将与该 ID 匹配的行添加到matches，并将不匹配的行id2添加到missing。

现在，missing包含所有不包含 的行id1，然后包含所有不包含 的行id2。请注意，包含id1不包含的行将id2出现在missing循环的第二次迭代中。

相反，请同时考虑所有 ID：

grep -f query_ids -Fw    my_file >matches
grep -f query_ids -Fw -v my_file >missing

在这里，我提供了grep使用query_ids. -f我要求grep将 中 的行视为query_ids查询字符串（-F，即不是正则表达式），并将它们作为my_file整个单词进行匹配（-w，以便与id2例如 不匹配id23）。

第一个命令将提取包含任何 ID 的所有行。第二个命令将提取不包含任何 ID 的所有行。

这里不需要任何类型的循环。