在 bash shell 中循环访问两组文件

Question

我在名为 Data 的文件夹中有 25 对相关文件。这些文件被命名为tcr1_r1.txt和tcr1_r2.txt、\xe2\x80\x82tcr2_r1.txt和tcr2_r2.txt，依此类推，直到 I\xc2\xa0reach tcr25\xe2\x80\xa6（或我有多少个文件对）。我的问题是我需要将它们配对并在批处理文件中的每对上运行命令。例子：

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\n命令  tcr1_r1.txt tcr2_r2.txt\n命令  tcr2_r1.txt tcr2_r2.txt\n

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我怎样才能做到这一点？我正在考虑一个循环，但我似乎无法分离和交替每个命令上的文件。我尝试了一个嵌套循环，但它只是运行每个“r1”文件和所有“r2”文件。

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for filename1 in /Data/*_r1.txt\ndo\n  for filename2 in /Data/*_r2.txt\n  do\n     echo "$filename1 and $filename2"\n  done\ndone\n

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我尝试使用Jeff Schaller\xe2\x80\x99s 答案.\xc2\xa0\n以下是我\xc2\xa0 尝试过的确切 shell 文件行：

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for filename1 in /Data/*_r1.txt\ndo\n  for filename2 in /Data/*_r2.txt\n  do\n     echo "$filename1 and $filename2"\n  done\ndone\n

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我\xc2\xa0一定是丢失了一些东西。\xc2\xa0\n我\xe2\x80\x99m\xc2\xa0收到\xc2\xa0“Bad\xc2\xa0substitution”错误消息。

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Answer 1

两种方式，取决于你是否要关心文件总数。

在第一种方式中，您知道文件数量为 25（具体命名为 1 到 25）：

for index in {1..25}
do
  command tcr"${index}"_r1.txt tcr"${index}"_r2.txt
done

上面，(bash) shell 将 展开{1..25}为完整的数字集；然后我们将这些数字替换到配对文件名中的适当位置。

第二种方式，你不知道也不关心有多少个文件：

for first in tcr*_r1.txt
do 
  command "$first" "${first/_r1.txt/_r2.txt}"
done

上面，我们循环遍历所有“r1”文件，并用“_r1.txt”部分替换成对的“_r2.txt”。