如何在 .gz 文件上使用 awk 提取信息而不将未压缩的数据存储在磁盘上

Question

我需要使用这个命令：

awk 'NR==FNR {a[$1]; next} $1 in a{print}' inputfile1.txt inputfile2.gen.gz >output.txt

Awk 不读取 .gz 文件。

我试过了

zcat inputfile2.gz | awk 'NR==FNR {a[$1]; next} $1 in a{print}' inputfile1.txt inputfile2.gen.gz >output.txt

它仍然不起作用。

Answer 1

给 Awk 一个破折号参数来读取它的标准输入。

zcat inputfile2.gz |
awk 'NR==FNR {a[$1]; next}
    $1 in a' inputfile1.txt - >output.txt

（还要注意我去掉了，{print}因为这已经是 Awk 中隐含的默认操作。）