SED 删除 csv 列（如果存在）

Question

如果此列存在，我需要从我的表格 CSV 文件中删除一列。

我的 CSV 文件：

GENE REF ALT
AKT  A   G
AKT  G   G

所需的输出：如果列 REF 存在删除此列

GENE  ALT
AKT    G
AKT    G

我试图这样做：

sed 's/\tREF.[^\t]*//' filename.csv

但它不起作用。

Answer 1

和 perl

$ perl -F'\t' -lane '@non_ref_cols = grep { $F[$_] ne "REF" } 0..$#F if $. == 1;
                     print join "\t", @F[@non_ref_cols]' ip.txt
GENE    ALT
AKT     G
AKT     G

• -F'\t' 使用制表符作为字段分隔符
• @non_ref_cols = grep { $F[$_] ne "REF" } 0..$#F if $. == 1 对于标题行，获取所有非字段的索引 REF
• print join "\t", @F[@non_ref_cols] 使用我们为标题行获得的索引数组打印所有字段，使用制表符作为字段分隔符

Answer 2

你好，米勒（http://johnkerl.org/miller/doc）和这个 input.csv

GENE,REF,ALT
AKT,A,G
AKT,G,G

很容易

mlr --csv cut -x -f REF input.csv

输出是

GENE,ALT
AKT,G
AKT,G