正确设置 LD_LIBRARY_PATH

Question

我正在将 Docker 与 Ubuntu 16.04 的图像一起使用。我正在使用这个 docker 来运行：

• 借助 boost.python 在 python 中导入 C++ 类
• 借助 Matlab Runtime (MCR) 在 python 中导入 matlab 的 python 包。

在 docker 中安装 MCR 之前，我已经使用以下命令安装了 boost：

$ sudo apt-get install -y libboost-all-dev

我能够包装 C++ 类并在 python 中调用它们。然后我安装了 MCR，其中一项要求是设置LD_LIBRARY_PATH为 Matlab 的库。

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

它起作用了，我能够在 python 中运行 matlab 的 python 包，但是由于LD_LIBRARY_PATH. 例如，当我尝试在 python 中导入 C++ 类时出现以下错误：

 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0: undefined symbol: XML_SetHashSalt

如果我取消设置LD_LIBRARY_PATHC++ 导入工作但 MCR 失败。那么问题LD_LIBRARY_PATH应该是什么才能成功运行 C++ 类和 Matlab 的 python 包？

我试图添加路径来提升库，LD_LIBRARY_PATH但没有用，所以 env 值是：

/usr/lib/x86_64-linux-gnu:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

编辑

设置之前的 C++ 库文件的依赖项LD_LIBRARY_PATH：

    linux-vdso.so.1 (0x00007ffcee0dc000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007f9d69e59000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007f9d69c09000)
    libstdc++.so.6 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 (0x00007f9d698fe000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007f9d695fd000)
    libgcc_s.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libgcc_s.so.1 (0x00007f9d693e7000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007f9d6903c000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007f9d68e34000)
    libexpat.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so.1 (0x00007f9d68c0b000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007f9d689f0000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007f9d687d3000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007f9d685cf000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007f9d683cc000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007f9d6a6c3000)

设置后the LD_LIBRARY_PATH：

    linux-vdso.so.1 (0x00007ffc42e9b000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007fad9635b000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007fad9610b000)
    libstdc++.so.6 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6 (0x00007fad95d8a000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007fad95a89000)
    libgcc_s.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libgcc_s.so.1 (0x00007fad95873000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007fad954c8000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007fad952c0000)
    libexpat.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64/libexpat.so.1 (0x00007fad95095000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007fad94e7a000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007fad94c5d000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007fad94a59000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007fad94856000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007fad96bc5000)

Answer 1

您有几个选择：

1. 在上面的语句中添加共享库的路径前缀export（您的系统上很可能$LD_LIBRARY_PATH没有设置，因此唯一设置的路径是在导出语句中显式设置的路径。）

    export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib/:/usr/lib/:/usr/lib64/:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64
   

   该export语句不会成为 shell 会话的永久部分，除非您将其添加到.bashrc仅供参考。

2. 添加 MATLAB 库路径/etc/ld.so.conf.d/并运行ldconfig以识别系统上链接器的新路径。

   （顺便说一句，我猜测MATLAB库名称。您可能需要将文件名命名MATLAB为全小写或其他名称以外的名称。基本上，我们需要库的名称，因为它在链接过程中被引用。您可以检查 make 文件以了解如何引用它。）

    # Add the file '/etc/ld.so.conf.d/MATLAB' with the following lines 
    /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64
    /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64
    /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64
    /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64
   

   然后运行ldconfig。

    sudo ldconfig
   

   您可能需要取消设置该$LD_LIBRARY_PATH变量以使链接器使用正常的系统搜索路径并选择 MATLAB 的新搜索路径。

    unset LD_LIBRARY_PATH
   

Answer 2

它对我有用的唯一方法是定义LD_PRELOAD并将其指向系统库。所以我当前的环境是：

LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/opengl/lib/glnxa64
LD_PRELOAD=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so

因此，在 docker 中，我创建了一个.matlab包含上述环境变量的文件。然后，在 dockerfile 中我添加了以下内容：

services:
  django: &django
    build:
      context: .
      dockerfile: ./compose/local/django/Dockerfile
    depends_on:
      - postgres
    volumes:
      - .:/app
      - shared_upload_tmp:/app_temp
      - media:/app/computation_server/media
    env_file:
      - ./.envs/.local/.django
      - ./.envs/.local/.postgres
      - ./.envs/.production/.matlab
    ports:
      - "8800:8000"
    command: /start