如何为列添加标题

Question

我有数据：

7456 7456 0 0 0 2
7463 7463 0 0 1 2

我想添加列标题，所以输出是：

FID IID PAT MAT SEX PHENOTYPE 
7456 7456 0 0 0 2
7463 7463 0 0 1 2

我试过了 echo -e "FID\tIID\tPAT\tMAT\tSEX\tPHENOTYPE" | cat file1 > file2

但这是复制原始文件而不是标题。

sed '1i\FID, IID, PAT, MAT, SEX PHENOTYPE' file1 > file2

有错误

sed: 1: "1i\FID, IID, PAT, MAT,  ...": extra characters after \ at the end of i command

请问有什么建议吗？

Answer 1

你的尝试

echo -e "FID\tIID\tPAT\tMAT\tSEX\tPHENOTYPE" | cat file1 > file2

几乎可以正常工作，但cat不会对其标准输入（包含实际标题）做任何事情。以下将起作用：

echo -e "FID\tIID\tPAT\tMAT\tSEX\tPHENOTYPE" | cat - file1 > file2

cat将解释-为标准输入，并echo在添加file1.

替代：

{ echo -e "FID\tIID\tPAT\tMAT\tSEX\tPHENOTYPE"; cat file1; } >file2

或者

( echo -e "FID\tIID\tPAT\tMAT\tSEX\tPHENOTYPE"; cat file1 ) >file2

Answer 2

这个 GNUsed将文本添加为​​文件的第一行：

sed  -i '1i FID IID PAT MAT SEX PHENOTYPE' test.txt