awk 帮助从特定列打印到最后

Question

我有一个这样的文件

gene    -   chr7    55675   55676   100 100
gene    -   chr7    55678   55679   100 100
gene    -   chr7    55683   55686   NP  100

该文件是制表符分隔的。

我想更改文件，使第 5 列应位于第 4 列，第 4 列应位于第 5 列，然后按原样打印所有列。我只显示第 5 列之后的 2 列，但可以有更多。

我试过了，cut -f 1,2,3,5,4,6-但它不起作用。

我更喜欢它的 awk 解决方案。

谢谢

Answer 1

交换字段 4 和 5：

$ awk -F'\t' '{a=$4; $4=$5; $5=a;} 1' OFS='\t' file
gene    -       chr7    55676   55675   100     100
gene    -       chr7    55679   55678   100     100
gene    -       chr7    55686   55683   NP      100

这个怎么运作：

• -F'\t'

  这将输入时的字段分隔符设置为选项卡。

• a=$4; $4=$5; $5=a

  这交换了第四个和第五个字段。

• 1

  这是 awk 对 print-the-line 的神秘简写。

• OFS='\t'

  这告诉 awk 使用制表符作为输出的字段分隔符。

保持标题不变

要交换除第一行以外的所有行上的字段：

awk -F'\t' -v OFS='\t' 'NR>1{a=$4; $4=$5; $5=a;} 1' file

NR是行号。所述NR>1放置在交换命令之前是一个条件。仅当条件为真时才会执行交换命令。

另类风格

一些造型师建议将 OFS 的赋值放在代码之前：

awk -F'\t' -v OFS='\t' '{a=$4; $4=$5; $5=a;} 1' file