如何根据第二列的编号从第一列中选​​择第 n 个字符

Question

在我的工作流程中，我创建了这个文件：

AAGGAGGGAGCTGCATGGAACCTGTGGATATATACACACAAGGTTAACCTCTGTCCTGTAAA  8  
GGAGTTCAGATGTGTGCTCTTCCGATCTGGAGGTCTCTGCTGGGGCCACCCTGTCCTCTCAG  30     
GAGAGAGGAAAGGAAGCGATTGCAGAACTTTCCACAAGGCTTTAGATTCCCCTGTCACAGAG  15  
GGAGGAGAAAGAATCAACTTTATAGCATCAGCCCCTTGTTTATTTTAAGTTCAGGGTTTAAG  13  
GGGAGAACATTTCCCTCCTTGTCCTCTCCTATCTCACTTACTACATTCCCACTGGTCACTGT  7  
GGGACATTTGTGATTACATGGTTGCAGTATTCTTTTTGTTCTTAGTCAGACTGTATAATTGG  4  

我想从第一列的每个文本中选择第二列数量中存在的第一个字母数。如第一行的前 8 个字符，第二行的前 30 个字符等。

像第一个例子一样，输出将是这样的：

AAGGAGGG  
GGAGTTCAGATGTGTGCTCTTCCGATCTGG

任何想法将不胜感激。

Answer 1

与awk：

awk '{ $0 = substr($1, 0, $2) } 1' file.txt

使用 GNU sed：

sed -r 's/.* ([0-9]+).*/s!^(.{\1}).*!\\1!/' file.txt | \
    cat -n | \
    sed -r -f - file.txt

（GNUsed因为它可以从 读取脚本文件stdin）。

与perl：

perl -lpe 's/.*?([ACTG]+)\s+(\d+).*/ substr($1, 0, $2)/e' file.txt

另一种方式perl：

perl -lape '$_ = substr($F[0], 0, $F[1])' file.txt