grep, awk, sed, 在 file1 和 file2 column3 中打印第 2 列匹配

Question

编辑：我想将 file1.txt 的第 1,2 列与 file2.txt 的第 1,3 列匹配并打印 file2.txt 的匹配行

文件1.txt：

scaffold1   57482
scaffold1   63114
scaffold1   63118
scaffold1   63129
scaffold1   63139
scaffold1   63279
scaffold1   63294
scaffold2   65015
scaffold2   77268
scaffold2   77335

文件2.txt：

scaffold1   381 382 T/A +
scaffold1   384 385 T/A,G   +
scaffold1   385 386 G/C +
scaffold1   445 446 C/T +
scaffold1   57481   57482   T/A +
scaffold1   63113   63114   T/A,G   +
scaffold1   63128   63129   G/C +
scaffold2   65014   65015   G/A +
scaffold2   77267   77268   G/A +
scaffold2   77334   77335   C/T +

输出.txt：

scaffold1   57481   57482   T/A +
scaffold1   63113   63114   T/A,G   +
scaffold1   63128   63129   G/C +
scaffold2   65014   65015   G/A +
scaffold2   77267   77268   G/A +
scaffold2   77334   77335   C/T +

Answer 1

一个awk解决方案：

$ awk 'NR==FNR{a[$1$2]++;next}{if($1$3 in a){print}}' file1 file2 
scaffold1   57481   57482   T/A +
scaffold1   63113   63114   T/A,G   +
scaffold1   63128   63129   G/C +
scaffold2   65014   65015   G/A +
scaffold2   77267   77268   G/A +
scaffold2   77334   77335   C/T +

NR是当前行号和FNR当前文件的当前行号。只有在读取第一个文件时，两者才相等。所以第一个块只会在读取第一个文件时执行，因此第一个文件的第一个和第二个字段保存在数组中a。然后，当处理第二个文件时，我们仅在第一个和第三个字段存在于 中时才打印其行a，因此仅当它存在于第一个文件中时。