如何在 shell 脚本程序中运行具有自己命令行的程序

Question

我需要编写一个 shell 脚本来通过现有程序自动运行一组文件 ~1000 次。我试图运行它们的程序是通过命令行访问的，如下所示，然后通过键入“加载文件类型文件名”来加载您希望程序使用的文件，如下所示：

server>./fbat

               *******************************************************
               *                                                     *
               *     *********  * * *          *       *********     *
               *     *          *     *       * *          *         *
               *     *******    *  * *       *   *         *         *
               *     *          *     *     * *** *        *         *
               *     *          *     *    *       *       *         *
               *     *          * * *     *         *      *         *
               *                                                     *
               *          Xin Xu  C1999-2009       v2.0.4Q       *
               *          Program for Population Genetics            *
               *          Harvard School of Public Health            *
               *                                                     *
               *******************************************************

>>load map leprmap.txt

read in 899 markers' info

>>load ped leprped.txt

read in: 899 markers from 16 pedigrees (338 nuclear families,1182 persons)

>>load phe phe_dbpsim2e1.txt

1 quantitative traits have been successfully read
719 persons have been phenotyped

>>trait resid

affection resid** 

>>fbat -v1 -e

（...这里有很多输出）

每次运行都会更改的文件是phe_dbpsim2e1.txt，其名称每次运行都会增加一个数字。我能够从脚本执行程序，但是一旦程序打开，它就无法识别我尝试通过脚本输入的任何命令（即加载），并且程序等待我手动输入命令. 退出程序后，脚本中的所有命令都会显示在屏幕上，因此我编写的脚本似乎在程序打开时暂停。

有没有办法在程序打开后将命令输入到程序中而无需手动输入？

Answer 1

如果fbat坚持从终端获取其输入并且您想自动化，则解决方案是使用expect(或pexpect)。这是一个expect脚本示例，它可能会自动执行您的程序：

#!/usr/bin/expect -f
spawn ./fbat
expect ">>"
send "load map leprmap.txt\r"
expect ">>"
send "load phe phe_dbpsim2e1.txt\r"
expect ">>"
send "trait resid\r"

因为我没有访问权限fbat，所以上面当然没有经过测试。

要expect在类似 debian 的系统上安装，请运行：

apt-get install expect