在 Docker 容器 (buster) 上安装 Prophet (pystan build)

Question

我想在 Docker 容器中安装fbprophet 。我的 Dockerfile 如下所示：

FROM python:3.7

RUN pip install --upgrade pip
RUN pip install fbprophet

使用以下堆栈跟踪在“pip install fbprophet”步骤中构建图像错误：

    Running setup.py install for fbprophet ... error
    ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: /usr/local/bin/python -u -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/tmp/pip-install-7ei5jssc/fbprophet_9a3a667ec353402389a02258feccfe51/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/tmp/pip-install-7ei5jssc/fbprophet_9a3a667ec353402389a02258feccfe51/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' install --record /tmp/pip-record-741oj2zp/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /usr/local/include/python3.7m/fbprophet
         cwd: /tmp/pip-install-7ei5jssc/fbprophet_9a3a667ec353402389a02258feccfe51/
    Complete output (10 lines):
    running install
    running build
    running build_py
    creating build
    creating build/lib
    creating build/lib/fbprophet
    creating build/lib/fbprophet/stan_model
    Importing plotly failed. Interactive plots will not work.
    INFO:pystan:COMPILING THE C++ CODE FOR MODEL anon_model_dfdaf2b8ece8a02eb11f050ec701c0ec NOW.
    error: command 'gcc' failed with exit status 1
    ----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: /usr/local/bin/python -u -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/tmp/pip-install-7ei5jssc/fbprophet_9a3a667ec353402389a02258feccfe51/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/tmp/pip-install-7ei5jssc/fbprophet_9a3a667ec353402389a02258feccfe51/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' install --record /tmp/pip-record-741oj2zp/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /usr/local/include/python3.7m/fbprophet Check the logs for full command output.

我在网上找到了一些建议，但我尝试过但没有成功（此时我构建了没有容器fbprophet并运行它的容器，因此我可以实时尝试命令）：

1. 这里的问题是gcc/g++ 没有安装。

• 我尝试过apt install g++ gcc，仍然无法构建（它们已经安装了）

2. pnmartinez 的评论表明缺少一些构建工具。

• 我做了apt-get install build-essential libncursesw5-dev libreadline-gplv2-dev libssl-dev libgdbm-dev libc6-dev libsqlite3-dev libbz2-dev libffi-dev zlib1g-dev（运行后apt-get upgrade，，），并重试，结果相同apt-get update。apt-get dist-upgrade

3. 此 GH 问题建议降级到pystan==2.18.

• 在 v0.6 中引入此提交之前 ，Prophet 将自身限制为 PyStan <=2.18.1，因此我尝试了 pip installprophet==0.5，但仍然失败。（我一直降到0.2，仍然失败。）然后我尝试了pip3 uninstall pystan && pip3 install pystan==2.18 && pip3 install fbprophet==0.5相同的结果。

4. 从 conda-forge 安装

• 我对此进行了研究，但是在 docker 容器中安装工作 conda env 似乎相当复杂

5. 我还开始尝试在基于 Alpine 的容器上安装，而不是在 Debian 上安装。

• 在 Prophet 阶段之前我就开始遇到问题，一般来说，我认为在非标准发行版上构建复杂的 C++ 项目不会更容易。

当 gcc 尝试构建 PyStan 模型时，似乎会出现该问题。我的猜测是，它只是内存不足（cc1plus进程top使用 2GB，大约 90% 的 RAM，有人声称这里最多可以使用 8GB）。然而，这是非常常见的软件，几个月前我成功地使用相同的 Dockerfile 安装了 fbprophet，所以我不确定为什么这会成为一个问题。（我尝试在 macOS (Big Sur) 和 Linux (Fedora 33) 上构建它，结果相同。）

Answer 1

弄清楚了——因为这是一个内存问题，我只需要为 Docker VM 分配更多内存即可。这个答案解释了如何使用 GUI 来做到这一点。浪费了很多时间...