小编Sim*_*man的帖子

我想使用Python将组ID获取到相应的组名.该例程必须适用于类Unix操作系统(Linux和Mac OS X).

这是我到目前为止所发现的

>>> import grp
>>> for g in grp.getgrall():
...     if g[0] == 'wurzel':
...         print g[2]

我想按字典键对字典列表进行排序,我不想区分大写和小写字符.

dict1 = {'name':'peter','phone':'12355'}
dict2 = {'name':'Paul','phone':'545435'}
dict3 = {'name':'klaus','phone':'55345'}
dict4 = {'name':'Krishna','phone':'12345'}
dict5 = {'name':'Ali','phone':'53453'}
dict6 = {'name':'Hans','phone':'765756'}
list_of_dicts = [dict1,dict2,dict3,dict4,dict5,dict6]

key_field = 'name'
list_of_dicts.sort(key=itemgetter(key_field))
# how to combine key=itemgetter(key_field) and key=str.lower? 
for list_field in list_of_dicts:
    print list_field[key_field]

应该提供

Ali, Hans, klaus, Krishna, Paul, peter

并不是

klaus, peter, Ali, Hans, Krishna, Paul

任务:
我使用python包pyExcelerator(与xlwt相比)从csv-files生成格式化的excel表.我需要能够写出小于或等于(≤)和大于或等于(≥)的符号.

到目前为止:
我可以将我的表保存为具有UTF-8编码的csv文件,这样我就可以通过在我的python源代码中添加以下行来查看文本编辑器中的特殊字符:

#! /usr/bin/env python
# -*- coding: UTF-8 -*-

问题:
但是,没有选择在pyExcelerator的Font类中选择UTF-8作为字体.唯一的选择是:

CHARSET_ANSI_LATIN          = 0x00
CHARSET_SYS_DEFAULT         = 0x01
CHARSET_SYMBOL              = 0x02
CHARSET_APPLE_ROMAN         = 0x4D
CHARSET_ANSI_JAP_SHIFT_JIS  = 0x80
CHARSET_ANSI_KOR_HANGUL     = 0x81
CHARSET_ANSI_KOR_JOHAB      = 0x82
CHARSET_ANSI_CHINESE_GBK    = 0x86
CHARSET_ANSI_CHINESE_BIG5   = 0x88
CHARSET_ANSI_GREEK          = 0xA1
CHARSET_ANSI_TURKISH        = 0xA2
CHARSET_ANSI_VIETNAMESE     = 0xA3
CHARSET_ANSI_HEBREW         = 0xB1
CHARSET_ANSI_ARABIC         = 0xB2
CHARSET_ANSI_BALTIC         = 0xBA
CHARSET_ANSI_CYRILLIC       = 0xCC
CHARSET_ANSI_THAI           = 0xDE
CHARSET_ANSI_LATIN_II       = 0xEE
CHARSET_OEM_LATIN_I         = 0xFF

这些字符集中的任何一个都包含小于或等于和大于或等于的符号吗？如果是这样,哪个？
哪个python编码名称对应于这些集合？还有另一种方法可以生成这些特殊字符吗？

任务:
将大量短DNA片段聚类在具有共同子序列模式的类中,并找到每个类的共有序列.

• 游泳池:约 300个序列片段
• 每个片段8到20个字母
• 4个可能的字母:a,g,t,c
• 每个片段分为三个区域:
  1. 5个通用字母
  2. g和c的8个或更多个位置
  3. 5个通用字母
     (正如所有的正则表达式[gcta]{5}[gc]{8,}[gcta]{5})

计划:
执行多重比对(即withClustalW2)以找到在区域2中共享共同序列的类及其共有序列.

问题:

1. 我的碎片是否太短,是否有助于增加它们的尺寸？
2. 区域2是否过于同质,只有两个允许的字母类型,用于显示其序列中的模式？
3. 您可以为此任务建议哪些替代方法或工具？

最好的祝福,

西蒙

我写了一个小python程序来迭代数据文件(input_file)并执行计算.如果计算结果达到某些状态(stateA或stateB),则从结果中提取信息(命中).要提取的命中数取决于三个参数集的参数.
我使用词典字典来存储我的参数集(param_sets)和列表来存储命中(命中).字典param_sets和hits具有相同的键.

问题是,

命中词典中的列表以某种方式耦合.当一个列表发生变化时(通过调用extract_hits函数),其他列表也会发生变化.

这里,(缩短)代码:

import os, sys, csv, pdb
from operator import itemgetter

# define three parameter sets
param_sets = {
    'A' : {'MIN_LEN' : 8, 'MAX_X' : 0, 'MAX_Z' : 0},
    'B' : {'MIN_LEN' : 8, 'MAX_X' : 1, 'MAX_Z' : 5},
    'C' : {'MIN_LEN' : 9, 'MAX_X' : 1, 'MAX_Z' : 5}}

# to store hits corresponding to …