从文档中,我知道我可以定义一个配置文件并通过以下方式使用它
snakemake --profile <name>
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我可以将这些配置文件之一设置为默认配置文件(在输入命令时使用snakemake)吗?
在 .bashrc 中定义别名是一种解决方法。然而,我想知道是否有“官方”snakemake 解决方案。
旁注:我对 Snakemake 默认配置文件的最初动机是定义默认的核心数量,这样我就不必总是键入
snakemake -j [cores]
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
默认核心数为“无”(对于我使用 conda 安装的 Snakemake)。
snakemake ×1