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没有EOF特征的Burrows-Wheeler变换

我需要在线性时间内执行着名的Burrows-Wheeler变换.我找到了一个带后缀排序和EOF字符的解决方案,但附加EOF会改变转换.例如:考虑字符串bcababa 和两个旋转

  • s1 = abababc
  • s2 = ababcab

很明显,s1 <s2.现在有了EOF字符:

  • s1 = ababa #bc
  • s2 = aba #bcab

现在s2 <s1.由此产生的转变将是不同的.如何在没有EOF的情况下执行BWT?

sorting string algorithm burrows-wheeler-transform

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