我得到了一个光谱参考数据库,它与我使用的样本数据集非常不同。在我的数据中,0 或 1 表示是否存在峰值,而在参考数据库中,峰值位置被列为行值并根据肽数据(我不需要)分组为列。
我的数据集如下所示:
Sample 1110 1111 1112
1 1 0 0
2 1 0 1
3 0 1 1
4 1 1 1
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
虽然参考数据库看起来像这样(注意每列的多个值):
Species peptide1 peptide2 peptide3
cow 1110 1112 NA
sheep 1111 1112 NA
goat NA 1113 1114
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
所需的输出看起来类似于我的数据集:
Species 1110 1111 1112 1113 1114
cow 1 0 1 0 0
sheep 0 1 1 0 0
goat 0 0 0 1 1
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这些过于简单,但它们说明了问题——如果我需要提供实际数据,请告诉我。我需要对单元格中的值进行转置/排序,同时替换二进制中的原始值(同样,我不需要在参考数据库中保留肽列名称)。我真的希望有一个简单的 dplyr 或 tidyr 技巧 - 我想一个扩展函数可以工作,但我不知道如何为多列做这件事,也不知道如何保留原始数据。或者,我可以手动将所有数据附加为长格式,然后将其熔化/转换为更宽的格式?