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在R中使用forceNetwork变得疯狂:没有显示边缘

我一直试图在R中使用networkD3包绘制网络一周.该simpleNetwork功能正常工作,但它不能很好地控制图形的外观.该forceNetwork功能就是为了这个目的:显示具有丰富视觉特征的图形.

我遇到的问题几乎与问题相同.我仔细阅读了包文档,并尝试了上述线程中提出的解决方案,没有运气:我得到的是一个没有边连接它们的节点云.

我的data.frames:

EDG

Gene1 Gene2 Prob
  1    22    3
  2    22    6
  3    22    6
  4    22    9
  5    22    3
  6    22    4
  7    22    8
  8    22    4
  9    22    6
 10    22    8
 11    22    6
 12    22   10
 13    22    6
 14    22    3
 15    22    6
 16    22    6
 17    22    0
 18    22    4
 19    22    6
 20    22    4
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VERT

Symbol Chr …
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plot r networkd3 htmlwidgets

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迭代两个data.tables'行的更优雅的方法

我开始越来越频繁地使用R,来自C/C++.出于这个原因,在使用R的数据结构时,我经常发现自己在思考C++.

在这里,我有两个data.tables,我必须迭代并更新表A中第1列和第2列的值,表B中的第2列的值,根据第1列表B表a中的第1列和第2列.

对不起这个令人困惑的描述.我试着让它变得更好

我有两个数据表(行数不同,因为它们实际上可能不同):

塔巴

     Col1     Col2
1:   TP53     CD68
2:   TP53    MPDU1
3:   TP53     PHF2
4:   TP53 KIAA0753
5:   CD68    ZBTB4
6:   CD68     CHD3
7:  MPDU1    ZBTB4
8:  MPDU1     CHD3
9:  MPDU1   SLC2A4
10: MPDU1     YBX2
11: MPDU1    AURKB
12: MPDU1 TMEM132B
13:  PHF2 C9orf129
14:  PHF2    CDH23
15:  PHF2   PTPDC1
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和TabB:

       Col3 Col4
1:   ADAM32  0
2:   ADARB2  1
3:    AGBL2  2
4:   ALOX12  3
5:  ANKRD46  4
6:    APOL1  5
7:    APOOL  6
8:     ASPA …
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r data.table

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r ×2

data.table ×1

htmlwidgets ×1

networkd3 ×1

plot ×1