小编Rya*_*son的帖子

我是否必须提交合并以使git-rerere记录我的冲突解决方案?

我正在使用git-rerere它的预期目的,在这些分支开发时逐步记录两个分支(主分支和主题分支)之间的冲突解决方案,而不会创建不必要的合并提交.然而,即使在阅读了git-rerere manpage后,我还不清楚rerere何时实际记录了我的冲突解决方案.我检测和解决新合并冲突的标准工作流程是git merge master从主题分支,解决冲突,然后暂存所有文件并提交合并git commit -m "Finished test merge",然后撤消合并使用git reset --hard HEAD^,只留下存储的记录分辨率git-rerere.

然而,这似乎有点傻.创建一个提交,然后撤消它只是为了记录分辨率?在阅读了联机帮助页后git-rerere,我仍然不清楚它何时记录我的决议.仅仅暂存冲突的文件是否足够,或者在解决冲突后我是否真的需要创建合并提交,就像我一直在做的那样?

git merge-conflict-resolution git-rerere

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在R中并行化矢量化函数的最简单方法是什么?

我有一个非常大的列表X和一个矢量化函数f.我想计算f(X),但如果我用一个核心来做这个将需要很长时间.我有(访问)48核服务器.并行计算的最简单方法是f(X)什么?以下不是正确的答案:

library(foreach)
library(doMC)
registerDoMC()

foreach(x=X, .combine=c) %dopar% f(x)
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上面的代码确实会对计算进行并行化f(X),但它会通过f单独应用于每个元素来实现X.这忽略了矢量化的性质,f并且可能会使事情变慢,而不是更快.而不是应用felementwise X,我想X分成合理大小的块并应用于f那些.

那么,我应该手动拆分X成48个相等大小的子列表然后f并行应用于每个子列表,然后手动将结果放在一起?或者是否有为此设计的包装?

如果有人想知道,我的具体用例就在这里.

parallel-processing r vectorization

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有效地向R中的向量或列表添加或删除元素?

我正在实现一个算法,该算法涉及从集合中添加和删除大量内容.在R中,这很慢,因为据我所知,从向量中添加或删除内容很慢,因为必须重新分配整个向量.有没有办法更有效地做到这一点?

编辑:我当前的解决方案是使用一个布尔向量,其长度与可以在集合中的事物列表相同,并将其用作成员资格表.

performance r vector

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给定两个(大)点集,我如何有效地找到彼此最近的对?

我需要解决一个计算问题,归结为搜索两组之间相互最近的点对.问题是这样的:

给定欧几里德空间中的一组点A和一组点B,找到所有对(a,b)使得b是B中与a的最近点,并且a是A到b中的最近点.

A组和B组的大小大致相等,我们将这个大小称为N.对于我的特殊问题,N大约为250,000.

蛮力解决方案是将每个点与每个其他点进行比较,其具有二次时间复杂度.有没有更有效的算法来做到这一点?

algorithm performance computational-geometry

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在python模块中打包支持R代码?

我正在尝试打包一些使用rpy2调用R代码的Python代码.那个R代码当前位于一个单独的文件中,我source来自Python脚本.例如,如果python脚本是myscript.py,那么R代码存储在myscript_support.R,我有类似以下内容myscript.py:

from rpy2.robjects import *

# Load the R code
r.source(os.path.join(os.path.dirname(__file__), "myscript_support.R"))

# Call the R function
r[["myscript_R_function"]]()
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我现在想用setuptools打包这个Python脚本,我有几个问题:

  1. 我应该如何打包R支持代码,一旦完成,我如何找到R文件的路径以便我可以获取它?

  2. R代码取决于几个R包.如何确保安装这些?如果无法加载这些R包,我是否应该提出信息错误?

python packaging r

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如何在特定点获得核密度估计值?

我正在尝试处理R中的过度绘图的方法,我想尝试的一件事是绘制单个点,但用它们的邻域密度来着色.为了做到这一点,我需要计算每个点的2D核密度估计.但是,似乎标准的核密度估计函数都是基于网格的.是否有在我指定的特定点计算2D内核密度估计值的函数?我想象一个函数将x和y向量作为参数并返回密度估计的向量.

r kernel-density

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在Perl中,在void上下文中使用map而不是foreach循环是否合适?

在Perl中,如果你有这样的循环:

foreach (@items) {
    perform_action($_);
}
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您可以通过调用mapvoid上下文来替换它:

map {
    perform_action($_)
} @items;
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这样做有什么优点或缺点?它是否会对性能产生影响,因为Perl认为必须保存结果?它是否会改善/恶化可读性?

perl foreach map

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在哪种语言中使用用户提供的正则表达式是一个安全漏洞?

编辑:tchrist告诉我,我对Perl不安全的原始指责是没有根据的.但问题仍然存在.

我知道在Perl中,你可以在正则表达式中嵌入任意代码,因此显然接受用户提供的正则表达式并匹配它允许任意代码执行并且是一个明显的安全漏洞.但对于使用正则表达式的所有语言都是如此吗?所有使用"Perl兼容"正则表达式的语言都适用吗?在哪些语言中,用户提供的正则表达式是否可以安全使用,以及哪些语言允许任意代码执行或其他安全漏洞?

regex security language-features

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在Perl/Moose中,如何将修改器应用于所有子类中的方法?

我有一个Moose类,它打算被子类化,每个子类都必须实现一个"execute"方法.但是,我想将一个方法修饰符应用于我的类中的execute方法,以便它适用于所有子类中的execute方法.但是当方法被覆盖时,方法修饰符不会被保留.有没有办法确保我的类的所有子类都将我的方法修饰符应用于它们的执行方法?

示例:在超类中,我有:

before execute => sub {
    print "Before modifier is executing.\n"
}
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然后,在其子类中:

sub execute {
    print "Execute method is running.\n"
}
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调用execute方法时,它没有说明"before"修饰符.

methods perl inheritance moose method-modifier

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如何立即运行生成器函数的初始化代码,而不是在第一次调用时?

我有一个生成器函数,如下所示:

def mygenerator():
    next_value = compute_first_value() # Costly operation
    while next_value != terminating_value:
        yield next_value
        next_value = compute_next_value()
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我希望初始化步骤(在while循环之前)在调用函数时立即运行,而不是仅在首次使用生成器时运行.有什么好办法呢?

我想这样做,因为生成器将在一个单独的线程(或进程,或任何多处理使用)中运行,我将不会在短时间内使用返回,并且初始化有点昂贵,所以我希望它我正准备使用这些值时进行初始化.

python eager generator multiprocessing

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