小编Alb*_*lby的帖子

以下一个班轮反过来打印出文件的内容

$ sed -n '1!G;h;$p' test.txt

当sed逐行读取文件时怎么可能？你能解释一下这个意思吗？

• n 旗
• 1!
• G
• h
• 和 $p

在这个命令？

我有以下格式的文件:

(类型1数据:1)
B
B
(类型1数据:2)
B
B
B
(类型1数据:3)
B
..

现在我想重新格式化这个文件,使它看起来像:

(类型1数据:1)BB
(类型1数据:2)BBB
(类型1数据:3)B
...

我的方法是在命令行中使用perl regex,

cat file | perl -pe 's/\n(B)/ $1/smg' 

我的理由是用空格替换新的线条字符.但它似乎没有用.你能帮我么？谢谢

如何使用行名称和列名称转换以下矩阵(或表/数据框),

    A       B
M   27143   18324
F   29522   18875

变成类似的东西

27143  M  A
18324  M  B
29522  F  A
18875  F  B

这样我才能在R中做一些分析？

如何使用perl正则表达式转换以下文本:

1100101
1100111
1110001
1110101

成

1 1 0 0 1 0 1
1 1 0 0 1 1 1
1 1 1 0 0 0 1
1 1 1 0 1 0 1

我试过用

perl -pe 's// /g' < text.txt

但它给了我一些有趣的结果:

 1 1 0 0 1 0 1
  1 1 0 0 1 1 1
  1 1 1 0 0 0 1
  1 1 1 0 1 0 1

假设我有以下列表:

test<-list(c("a","b","c"),c("a"),c("c"))
>test
[[1]]
[1] "a" "b" "c"

[[2]]
[1] "a"

[[3]]
[1] "c"

我该怎么做(或使用函数)来获取列表中的唯一项目的频率,如下所示:？

a 2
b 1
c 2

我尝试使用表(测试),但我得到以下错误

> table(test)
Error in table(test) : all arguments must have the same length

基本上,我想将一个列文件转换为由行数指定的多个列文件.

我不想重新发明轮子.我想在编写自定义脚本之前确保是否有unix命令/或标准方法.

例如,假设我有以下文件:

$cat input.txt
tom
jack
kim
bart
foo
bar

我想把它变成3行文件

$ cat input.txt | my_script --every=3 --delimiter=tab
tom bart
jack foo
kim bar

或具有不同分隔符的2行文件:

$ cat input.txt | my_script --every=2 --delimiter=,
tom,kim,foo
jack,bart,bar

我知道

g/PATTERN/m $

将所有匹配PATTERN的文本移动到文件末尾.我如何完成相反的工作？(即到文件的顶部)？

以下是Perl可以做的许多很酷的事情之一

my ($tmp) = ($_=~ /^>(.*)/);

它在循环中的当前行中找到模式^>.*,并将它存储在$ tmp变量的括号中.

我很好奇的是这种语法背后的概念.如何以及为什么(在什么前提下)这有效？我的理解是片段$ _ =〜/^>(.*)/是一个布尔上下文,但括号将它呈现为列表上下文？但是,为什么只有匹配模式中括号中的内容存储在变量中？!

这是变量赋值的某种特殊情况,我必须"记住"或者这可以完全解释吗？如果是这样,这个功能叫什么(名称如"autovivifacation？")

我有一些我想要可视化的序列特征信息.这是一些玩具数据(最后重新生成数据的具体r代码)

          type index variable position
...
14         CDS    14    start 31129
15        exon    15    start 32196
16         CDS    16    start 32196
17  stop_codon    17    start 32247
18        exon     1      end 12166
19         CDS     2      end 12166
...

我用来生成以下图的命令是

qplot(position,type,data=m2data,color=type)+xlim(11950,15000)

但是我想在"开始"和"结束"之间添加线段,这些线段与下面共享相同的"索引",这是我用油漆制作的.

如何用R中的ggplot2实现这个目标？

以下是数据

m2data<-structure(list(type = structure(c(2L, 1L, 3L, 2L, 1L, 2L, 1L, 
4L, 2L, 2L, 1L, 3L, 2L, 1L, 2L, 1L, 4L, 2L, 1L, 3L, 2L, 1L, 2L, 
1L, 4L, 2L, 2L, 1L, 3L, 2L, 1L, 2L, 1L, 4L), class = …

在 jinja2 中，我尝试多次使用模板动态创建 html 文档。我的 python 脚本如下所示：

# In my python script
env = Environment()
env.loader = FileSystemLoader('.')
base_template = env.get_template('base_template.html')

# each has the actual content and its associated template 
content1 = ("Hello World", 'content_template.html') 
content2 = ("Foo bar", 'content_template.html')


html_to_present = [content1[1], content2[1]]

# and render. I know this is wrong 
# as I am not passing the actual content, 
# but this is the part I am struggling with. More below
base_template.render(include_these=html_to_present, ).encode("utf-8"))

我的基本模板如下所示：

#################
# base_template.html …