小编loc*_*cus的帖子

将 lapply 与 emmeans 列表结合使用

我正在使用该emmeans软件包,但无法理解为什么它会起作用

\n
library(emmeans)\nmod <- lm(mpg ~ disp + hp, data = mtcars)\nl1 <- emmeans(mod, list("disp","hp"))\n\nfor (x in l1) {print(data.frame(x))}\n\n      disp   emmean        SE df lower.CL upper.CL\n1 230.7219 20.09062 0.5527102 29 18.96021 21.22104\n        hp   emmean        SE df lower.CL upper.CL\n1 146.6875 20.09062 0.5527102 29 18.96021 21.22104\n
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但这不是吗?

\n
lapply(l1, function(x) data.frame(x))\n\n Error in as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE) : \ncannot coerce class \xe2\x80\x98"function"\xe2\x80\x99 to a data.frame\n
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)\n

使用普通列表,我得到预期的输出(列表中的数据帧):

\n
l2 <- list(a=matrix(c(1,2,3,4)), b=matrix(c(5,6,7,8)))\nlapply(l2, function(x) data.frame(x))\n$a\n  x\n1 1\n2 2\n3 1\n4 3\n\n$b\n  x\n1 …
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r lapply emmeans

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使用 emtrends 获取简单效果的显着性

我可以通过下面的代码得到两两比较的意义

m <- lmer(angle ~ recipe*temp + (1|replicate), data=cake)
emtrends(m, pairwise~recipe, var="temp")

$emtrends
 recipe temp.trend         SE  df   lower.CL  upper.CL
 A       0.1537143 0.02981898 250 0.09498586 0.2124427
 B       0.1645714 0.02981898 250 0.10584300 0.2232999
 C       0.1558095 0.02981898 250 0.09708110 0.2145379

$contrasts
 contrast     estimate        SE  df t.ratio p.value
 A - B    -0.010857143 0.0421704 250  -0.257  0.9641
 A - C    -0.002095238 0.0421704 250  -0.050  0.9986
 B - C     0.008761905 0.0421704 250   0.208  0.9765
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但是,如果我对每个趋势recipe本身是否重要感兴趣怎么办?我怎样才能得到 的意义$emtrends

r lme4 mixed-models emmeans

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绘制无点回归平面-R

dat <- data.frame(nitrogen = runif(50, 0, 10), temperature= rnorm(50, 10, 3))
modmat <- model.matrix(~ nitrogen * temperature, dat)
coeff <- c(1, 2, -1, 1.5)
dat$soil <- rnorm(50, mean = modmat %*% coeff, sd = 0.5)
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我试图绘制回归平面,显示了如何temperature温和派之间的关系nitrogensoil

library(plot3D)

x <- dat$nitrogen
y <- dat$temperature
z <- dat$soil

fit <- lm(z ~ x*y)

grid.lines = 26
x.pred <- seq(min(x), max(x), length.out = grid.lines)
y.pred <- seq(min(y), max(y), length.out = grid.lines)
xy <- expand.grid( x = x.pred, …
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plot regression r

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