小编Ira*_*da 的帖子

如何处理线性混合模型(lme4)中的奇异拟合?

我正在运行几个线性混合模型,以研究将鸟巢作为随机变量的鸟类。问题是,在其中一些模型中,我得到了所谓的“奇异拟合”:我的嵌套随机变量的方差和st误差为0.00。

一些背景:我正在与野生鸟类合作,以观察在嘈杂环境中生活对某些氧化应激参数的影响。为此,我们为每个巢中的每个雏鸟取了一份血液样本,以做实验室的工作。由于血液样本有限,无法针对每个雏鸟都测量某些氧化应激参数。

model <- lmer(antioxidant_capacity~age+sex+clutch+zone+(1|nestID),
 data=data, contrasts=list(sex=contr.sum, zon=contr.sum, clutch=contr.sum))
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

然后我得到:

singular fit
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

这是表:

REML criterion at convergence: 974.3

Scaled residuals: 
 Min       1Q   Median       3Q      Max 
-2.72237 -0.61737  0.06171  0.69429  2.88008 

Random effects:
Groups   Name        Variance     Std.Dev.
nestID (Intercept)      0          0.00   
Residual               363        19.05   
Number of obs: 114, groups:  nido_mod, 46

Fixed effects:
        Estimate      Std. Error  df        t value Pr(>|t|)    
(Intercept) 294.5970    36.8036  109.0000   8.005   1.41e-12 ***
age          -0.2959     3.0418  109.0000  -0.097   0.922685    
clutch1      -0.5242     2.0940  109.0000  -0.250   0.802804    
sex1          2.3167 …
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