我已经和包含基因表达数据的大量文件一起工作了一段时间,最近我遇到了在升级到R 3.5.0之后将数据加载到R中的问题.使用大约8GB的内存(我的Mac有16GB的RAM)后,如果我尝试读取另一个文件,我会收到以下错误:
Error: vector memory exhausted (limit reached?)
我找到了上一篇文章(错误:向量内存耗尽(达到限制？))建议我尝试将环境变量R_MAX_VSIZE设置为更高的值,所以我尝试了以下内容:
Sys.setenv(R_MAX_VSIZE = 16e9)
但是,我仍然有同样的错误.我没有正确设置环境变量吗？有什么我想念的吗？
会话信息:
R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)
Running under: macOS High Sierra 10.13.5
Matrix products: default
BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/lib/libRlapack.dylib
locale:[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages: [1] data.table_1.11.4
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.5.0 tools_3.5.0