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我曾尝试针对以下问题制定解决方案：我有一个 .gff3 文件，我想将基因标头替换为简化名称。原始基因标题和新基因名称都在一个单独的文件中给出，原始名称在第 1 列中，新名称在第 2 列中。 如何使用 sed（我认为 sed 最适合这里）来替换所有出现在 .gff3 文件的第二列中使用新的缩短名称？

示例行 .gff3 文件：

tulip_contig_65_pilon_pilon .   contig  1   93354   .   .   .   ID=tulip_contig_65_pilon_pilon;Name=tulip_contig_65_pilon_pilon
tulip_contig_65_pilon_pilon maker   gene    19497   23038   .   +   .   ID=maker-tulip_contig_65_pilon_pilon-augustus-gene-0.4;Name=maker-tulip_contig_65_pilon_pilon-augustus-gene-0.4
tulip_contig_65_pilon_pilon maker   mRNA    19497   23038   .   +   .   ID=maker-tulip_contig_65_pilon_pilon-augustus-gene-0.4-mRNA-1;Parent=maker-tulip_contig_65_pilon_pilon-augustus-gene-0.4;Name=maker-tulip_contig_65_pilon_pilon-augustus-gene-0.4-mRNA-1;_AED=0.00;_eAED=0.00;_QI=418|1|1|1|0|0|3|2100|206

示例行替换文件：

augustus_masked-tulip_contig_306_pilon_pilon-processed-gene-0.1   gene1
maker-tulip_contig_306_pilon_pilon-augustus-gene-0.12 gene2
maker-tulip_contig_65_pilon_pilon-augustus-gene-0.4   gene3

Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

预期结果：

tulip_contig_65_pilon_pilon   .   contig  1   93354   .   .   .   ID=tulip_contig_65_pilon_pilon;Name=tulip_contig_65_pilon_pilon
tulip_contig_65_pilon_pilon   maker   gene    19497   23038   .   +   .   ID=gene3;Name=gene3
tulip_contig_65_pilon_pilon   maker   mRNA    19497   23038   .   +   .   ID=gene3-mRNA-1;Parent=gene3;Name=gene3-mRNA-1;_AED=0.00;_eAED=0.00;_QI=418|1|1|1|0|0|3|2100|206

Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我曾尝试使用：

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