小编Blu*_*een的帖子

我是Snakemake的新手，我想编写一个非常简单的Snakefile，其规则将每个输入文件分别处理为一个输出文件，但是由于某种原因，我的通配符无法正确解释。

我在Ubuntu 18.04中使用输入文件“ test / test1.txt”，“ test / test2.txt”和Snakefile设置了一个最小的，可重现的示例环境。（snakemake版本5.5.4）

Snakefile：

ins = glob_wildcards("test/{f}.txt")

rule all:
  input: expand("out/{f}.txt", f=ins)

rule test:
  input: "test/{f}.txt"
  output: "out/{f}.txt"
  shell: "touch {output}"

生成作业的DAG时，此Snakefile引发以下错误：

Missing input files for rule test:
test/['test1', 'test2'].txt

任何想法如何解决此错误？

我有三个类：一个基类A和两个类B，C它们都扩展A. A并且B在同一个包裹中并且C在不同的包裹中。

两者都有，B并且C有一个受保护的成员变量。A有一个方法（让我们称之为reflect），它使用反射和字符串输入通过this指针访问具有子类名称的字段。

reflect从B对象调用是可以的，但是从C对象调用它会导致 IllegalAccessException。我无法理解这个异常，因为这意味着C没有访问权限来访问它自己的成员变量。为什么java不允许这种反射？

这是一个 MWE 来澄清我的意思：

在parent/A.java：

package Parent;
public abstract class A {
    public Object reflect(String parameter) throws NoSuchFieldException, IllegalAccessException{
        Class cl = getClass();
        return cl.getDeclaredField(parameter).get(this);
    }
}

在parent/B.java：

package Parent;
public class B extends A{
    protected Integer b;
    public B(Integer b){
        this.b …