我想知道是否有人知道如何在 Sun Grid Engine 计算环境中正确使用 Snakemake - 我正在使用共享 HPC 集群并同时运行许多作业，但对调度程序来说，排队数千个几乎相同的作业是一个很大的压力互相依赖。
我过去曾使用数组作业来绕过这个瓶颈和服务器管理员的电子邮件，但还没有找到一个好的资源来学习如何使用 Snakemake 有效地安排数组作业。
过去有人这样做过吗？
目前从命令开始：
snakemake --jobs 500 \
--cluster "qsub -pe smp 12 -cwd -j y -o snake.log"