我有很多生成绘图的函数,通常使用ggplot2.现在,我正在生成情节并测试基础数据.但我想知道是否有合理的方法来测试该图包含我期望的图层/选项或图形元素是否符合预期.
例如:
library(ggplot2)
library(scales) # for percent()
library(testthat)
df <- data.frame(
Response = LETTERS[1:5],
Proportion = c(0.1,0.2,0.1,0.2,0.4)
)
#' @export plot_fun
plot_fun <- function(df) {
p1 <- ggplot(df, aes(Response, Proportion)) +
geom_bar(stat='identity') +
scale_y_continuous(labels = percent)
return(p1)
}
test_that("Plot returns ggplot object",{
p <- plot_fun(df)
expect_is(p,"ggplot")
})
test_that("Plot uses correct data", {
p <- plot_fun(df)
expect_that(df, equals(p$data))
})
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这就是我被困住的地方
test_that("Plot layers match expectations",{
p <- plot_fun(df)
expect_that(...,...)
})
test_that("Scale is labelled percent",{
p <- plot_fun(df)
expect_that(...,...)
})
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
也许有更直接的方法?
使用一个R markdown文件,我想创建不同的输出pdf文档,其中输出文件名应在文档中定义.有没有办法说服markdown以这种方式操纵输出文件名?理想情况下,我想通过r块传递文件名.
我正在尝试使用roxygen2记录R包中的一些数据集.仅考虑其中一个:
mypkg/data/CpG.human.GRCh37.RDaCpG.human.GRCh37和一个名为:的文件mypkg/R/cpg-data.R,其中包含:
#' @name CpG.human.GRCh37
#' @title CpG islands - human - genome build: GRCh37/hg19
#' @description This data set list the genomic locations of human CpG islands,
#' with coordinates based on the GRCh37 / hg19 genome build.
#' @docType data
#' @usage CpG.human.GRCh37
#' @format a \code{RangedData} instance, 1 row per CpG island.
#' @source UCSC Table Browser
#' @author Mark Cowley, 2012-03-05
#' @export
NULL
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)当我进行roxygenize时,会创建它mypkg/man/CpG.human.GRCh37.Rd,包含:
\docType{data}
\name{CpG.human.GRCh37}
\alias{CpG.human.GRCh37} …Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 我试图了解来自Java背景的Scala期货:我知道你可以写:
val f = Future { ... }
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
那我有两个问题:
此外,如何实现a scheduledFuture,在特定时间延迟后执行的?谢谢
我希望PHP脚本在命令行和网站上运行(我使用Apache和Nginx)所以我把#!/ usr/bin/php放在我脚本的第一行但是出现在网站上......
我正在尝试为R Markdown文件编写一个Jekyll转换器.我创建RMarkdownConverter.rb并将其放在我的_plugins目录中.我已经验证其他插件正在运行,但这个不是.我也没有看到任何错误消息,包括我自己放置的消息.似乎没有使用它.但是,Jekyll正在为我的.Rmd文件生成一个HTML文件,但只是将R chuck作为代码查询处理.任何帮助或想法将不胜感激.
RMarkdownConverter.rb 文件:
module Jekyll
class RMarkdownConverter < Converter
safe true
priority :low
def setup
STDERR.puts "Setting up R Markdown..."
return if @setup
require 'rinruby'
@setup = true
rescue
STDERR.puts 'do `gem install rinruby`'
raise FatalException.new("Missing dependency: rinruby")
end
def matches(ext)
ext =~ /Rmd/i
end
def output_ext(ext)
'.html'
end
def convert(content)
setup
STDERR.puts "Using R Markdown..."
R.eval "require(knitr)"
R.eval "render_markdown(strict=TRUE)"
R.assign "content", content
STDERR.puts content
R.eval "out <- knit(text=content)"
R.eval "print(out)"
end …Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 我似乎无法找到一种在Xtend中表达以下内容的好方法,而不需要使用while循环:
for(int i = 0; i < 3; i++){
println("row ");
}
println("your boat");
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
所以,我猜我的问题有两个部分:
我最终滚动自己,得到如下内容:
class LanguageUtil {
def static Iterable<Integer> range(int stop) {
range(0, stop)
}
def static Iterable<Integer> range(int start, int stop) {
new RangeIterable(start, stop, 1)
}
def static Iterable<Integer> range(int start, int stop, int step) {
new RangeIterable(start, stop, step)
}
}
// implements Iterator and Iterable which is bad form.
class RangeIterable implements Iterator<Integer>, Iterable<Integer> {
val …Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 我已经获得了一些地区的数字高程地图(地球高度图).我的目标是创造逼真的地形.
地形生成没问题.我已经使用VC#和XNA框架练习了这个.
问题是那些高度图文件是GeoTIFF格式,我不知道如何阅读.我以前也没有阅读任何图像文件的经验,这样我就可以使用互联网上有关读取GeoTIFF文件的小技巧来试验一些东西.到目前为止,我一直没有成功.
如何阅读这些文件:)
我所拥有的文件来自ASTER G-DEM Version-2 LINK TO OFFICIAL DESCRIPTION根据它们GeoTIFF是非常标准的,因为我dwonloaded的一些GeoTIFF展示台向我展示了正确的数据.
我将使用C#.如果我们谈论这种语言,我将不胜感激.
好吧,我得到了诽谤,这就是我所做的,
using (Tiff tiff = Tiff.Open(@"Test\N41E071_dem.tif", r"))
{
int width = tiff.GetField(TiffTag.IMAGEWIDTH)[0].ToInt();
int height = tiff.GetField(TiffTag.IMAGELENGTH)[0].ToInt();
double dpiX = tiff.GetField(TiffTag.XRESOLUTION)[0].ToDouble();
double dpiY = tiff.GetField(TiffTag.YRESOLUTION)[0].ToDouble();
byte[] scanline = new byte[tiff.ScanlineSize()];
ushort[] scanline16Bit = new ushort[tiff.ScanlineSize() / 2];
for (int i = 0; i < height; i++)
{
tiff.ReadScanline(scanline, i); //Loading ith Line
MultiplyScanLineAs16BitSamples(scanline, scanline16Bit, 16,i);
}
}
private static void …Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 我想我的指定的输入的每一行id-这应该是一个数0来N - 1,其中N在输入的行数.
粗略地说,我希望能够做到以下几点:
val data = sc.textFile(textFilePath, numPartitions)
val rdd = data.map(line => process(line))
val rddMatrixLike = rdd.zipWithIndex.map { case (v, idx) => someStuffWithIndex(idx, v) }
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
但是在Apache Flink中.可能吗?
我正在尝试为maxent分类器创建Java实现。我需要将句子分为n不同的类别。
我看了斯坦福maxent分类器中的ColumnDataClassifier。但是我不明白如何创建训练数据。我需要训练数据的形式,其中训练数据包括用于单词的POS标签,以便用于分类的功能将类似于上一个单词,下一个单词等。
我正在寻找带有POS TAGGING句子和句子类别的训练数据。例如:
我/(POS)名称/(POS)是/(POS)XYZ /(POS)类别
任何帮助将不胜感激。
我想使用交互式闪亮应用程序生成R降价页面。它工作正常,但输出在带有滚动条的很小区域中。我想摆脱滚动条,并显示不带滚动条的全宽和全高2个图形。我该如何实现?
我已经尝试过:
options(width = 800)
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---
title: "Spielercluster"
output: html_document
runtime: shiny
---
```{r,echo=FALSE}
library(ggplot2)
library(shiny)
data<-read.csv2('data.csv',header=T,sep=",")
rawData<-read.csv2('rawData.csv',header=T,sep=",")
cluster<-read.csv2('cluster.csv',header=T,sep=",")
colors<-c("green","red","black")
ui<-fluidPage(plotOutput("plot1", hover = "plot_hover"),
plotOutput("plot2", hover = "plot_hover"),
verbatimTextOutput("info")
)
server <- function(input, output) {
output$plot1 <- renderPlot({
ggplot(rawData, aes(koerpergewicht, groesse, color = factor(data$gruppe))) +
geom_point() + labs(title = paste(nlevels(factor(colors))))+geom_point(size=8)+geom_text(aes(label=position),vjust=-1.5)+scale_color_manual(name = "Gruppe",
labels = c("1 schwer", "2 leicht","3 Zwischengruppe"),
values = c(rgb(0.9725490196078431,0.4627450980392157,0.4274509803921569,1),rgb(0,0.7294117647058824,0.2196078431372549,1),rgb(0.3803921568627451,0.6117647058823529,1,1)))+ggtitle("Original")
})
output$plot2 <- renderPlot({
ggplot(rawData, aes(koerpergewicht, groesse, color = factor(cluster$x))) +
geom_point() + labs(title = paste(nlevels(factor(colors))))+geom_point(size=8)+geom_text(aes(label=position),vjust=-1.5)+scale_color_manual(name = …Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) r ×5
knitr ×3
r-markdown ×3
scala ×2
apache ×1
apache-flink ×1
c#-4.0 ×1
concurrency ×1
for-loop ×1
foreach ×1
future ×1
geotiff ×1
ggplot2 ×1
gis ×1
java ×1
jekyll ×1
markdown ×1
maxent ×1
nginx ×1
packaging ×1
php ×1
promise ×1
rd ×1
roxygen2 ×1
scheduling ×1
shell ×1
shiny ×1
testing ×1
testthat ×1
unit-testing ×1
xtend ×1